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Enregistrement W3133834070 · doi:10.21203/rs.3.rs-260480/v1

RNAi Screening in Primary Human Breast Biopsies Identifies Mitochondrial Glutamate Flux as A Metabolic Vulnerability in Locally Advanced Breast Cancer

2021· preprint· en· W3133834070 sur OpenAlexaff
Caterina Iorio, Alla Bouzina, Katarzyna J. Jerzak, David W. Andrews, Robert A. Screaton

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreSunnybrook Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerVulnerability (computing)Flux (metallurgy)Human breastMedicineBiologyCancer researchOncologyInternal medicineCancerChemistryComputer scienceComputer security

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Breast cancer (BC) is a leading cause of death in women[1]. Women with Locally Advanced Breast Cancer (LABC) have high risk disease with either large primary breast tumours and/or lymph node involvement. While neoadjuvant chemotherapy eradicates breast cancer in approximately one-third of cases prior to surgery, almost 70% of patients have residual disease and many will require additional chemotherapy post-operatively. Improving pre-operative efficacy of neoadjuvant systemic treatments while reducing their iatrogenicities are critical unmet needs. Methods: Here, we develop an RNA interference (RNAi) screening approach using conditionally reprogrammed primary LABC biopsies to identify genes of the mitochondrial Solute Ligand Carrier 25 (SLC25) family that support LABC cell viability. Results: We report that silencing SLC25A12, -A15, and -A18 genes, involved in glutamate and ornithine flux, augment 5-fluorouracil (5FU) cytotoxic effectiveness in LABC cells. Conclusions: Our data suggest glutamate metabolism may be a tumour-specific metabolic vulnerability in LABC. Furthermore, we demonstrate that RNAi screening in conditionally reprogrammed primary human breast cells can identify novel targets for the development of non-genotoxic BC treatments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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