Physiological changes and transcriptome profiling in Saccharum spontaneum L. leaf under water stress and re-watering conditions
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
As the polyploidy progenitor of modern sugarcane, Saccharum spontaneum is considered to be a valuable resistance source to various biotic and abiotic stresses. However, little has been reported on the mechanism of drought tolerance in S. spontaneum. Herein, the physiological changes of S. spontaneum GXS87-16 at three water-deficit levels (mild, moderate, and severe) and after re-watering during the elongation stage were investigated. RNA sequencing was utilized for global transcriptome profiling of GXS87-16 under severe drought and re-watered conditions. There were significant alterations in the physiological parameters of GXS87-16 in response to drought stress and then recovered differently after re-watering. A total of 1569 differentially expressed genes (DEGs) associated with water stress and re-watering were identified. Notably, the majority of the DEGs were induced by stress. GO functional annotations and KEGG pathway analysis assigned the DEGs to 47 GO categories and 93 pathway categories. The pathway categories were involved in various processes, such as RNA transport, mRNA surveillance, plant hormone signal transduction, and plant-pathogen interaction. The reliability of the RNA-seq results was confirmed by qRT-PCR. This study shed light on the regulatory processes of drought tolerance in S. spontaneum and identifies useful genes for genetic improvement of drought tolerance in sugarcane.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle