Functional interaction of ubiquitin ligase RNF167 with UBE2D1 and UBE2N promotes ubiquitination of AMPA receptor
Notice bibliographique
Résumé
Protein ubiquitination has been historically associated with protein degradation, but recent studies have demonstrated other cellular functions associated with substrate ubiquitination. Among the RING-type ubiquitin E3 ligase enzymes present in the human genome, RNF167 is a transmembrane protein located in endosomes and lysosomes and is implicated in controlling the endolysosomal pathway. Substrates of RNF167 have been identified, but the ubiquitin-conjugating E2 enzymes involved in the mechanism remain unknown. In this study, we describe the interaction between RNF167 and conjugating E2 enzymes. By means of in vitro autoubiquitination and binding assays, we show that RNF167 functionally interacts with many conjugating E2s, while fluorescence microscopy illustrates that these interactions occur in endosomes and lysosomes. Kinetic analyses of the interaction between RNF167 and selected conjugating E2 enzymes reveal submicromolar dissociation constants. The computed model of interaction between the RING domain of RNF167 and conjugating enzymes gives us insights on how RNF167 could interact with conjugating E2 enzymes. Furthermore, the results reveal that in vitro polyubiquitination of the AMPA-type glutamate receptor subunit GluA2, one of the RNF167's known substrates, is possible by the conjugating E2 enzyme UBE2N only after GluA2 has been primed by ubiquitin subsequent to the action of an initiating conjugating E2 enzyme functionally binding RNF167. Pharmacological inhibition of UBE2N in cultured hippocampal neurons diminishes AMPA-induced GluA2 ubiquitination. This study characterizes interacting partners of RNF167 and constitutes an initial step toward the identification of functional pairs assembled from RNF167 and ubiquitin-conjugating E2 enzymes involved in the ubiquitination of RNF167's substrate.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».