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Enregistrement W3133961424 · doi:10.1093/jcag/gwab002.002

A3 THE LOSS OF THE CIRCADIAN CLOCK GENE BMAL1 INCREASES TUMOUR INITIATION IN APCMIN MICE

2021· article· en· W3133961424 sur OpenAlexaff
Malika Nunes, Chantelle Trombley, Danilo E. F. L. Flôres, Guojun Wu, Colin Curran, Z Taleb, John B. Hogenesch, Phillip Karpowicz

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCircadian rhythmCircadian clockBiologyCLOCKOscillating geneGeneticsCell biologyInternal medicineEndocrinologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Circadian rhythms are autonomously running 24h cycles in bodily processes. In animals these rhythms are driven by a molecular time keeper known as the circadian clock. The clock is a transcription-translation feedback loop composed of the transcription factors Bmal1 and Clock as well as their repressors Per and Cry. The circadian clock regulates over 40% of the genome rhythmically. Chronic circadian disruption, in the case of shift work, can lead to pathologies including cancer. Colorectal cancer is most frequently initiated through a mutation in the Wnt pathway regulator, Apc. Several studies have attempted to provide a mechanistic link between cancer and circadian clock disruption but the use of mice on mixed genetic backgrounds and poor circadian models have made this link unclear. Aims We aim to determine if the circadian clock plays a role in intestinal tumourigenesis. Methods We crossed the Apcmin mouse strain, a common intestinal tumour model, with Bmal1 mutant mice, which lack a functioning circadian clock. After creating an isogenic strain, we examined the number of tumours in control (Bmal1+/+) and clock dead (Bmal1-/-) animals. We derived organoids, a 3D cell culture method, from Apc+/+; Bmal1+/+ (healthy, clock-live), Apc+/+, Bmal1-/-(healthy, clock-dead), Apcmin; Bmal1+/+(adenoma, clock-live), Apcmin; Bmal1-/- (adenoma, clock-live) mouse ileum and collected every 2h from 24-48h after synchronizing their circadian clock. Collected samples were sent for RNA sequencing and assessed for circadian regulated transcripts. This experiment was followed up by in vitro organoid assays. Results The circadian clock controls 41 genes in the intestinal epithelium, including genes like Tead4 which are known to be important in intestinal biology. There are twofold more tumours in Bmal1-/- mice than their Bmal1+/+ littermates, and Bmal1-/- tumours upregulate Tead4 and Hippo pathway targets and downregulate Wnt pathway targets. Bmal1-/- adenoma organoids show increased self-renewal when compared to Bmal1+/+ adenoma organoids. However, this increase in self-renewal is lost when organoids are treated with inhibitors of the hippo pathway. Conclusions The circadian clock is important in maintaining the health of an organism, and disruption of the clock can lead to many health consequences including cancer. We show for the first time that the circadian clock controls the hippo signaling mediator Tead4. Additionally, we show that the loss of the clock leads to an increase in the number of tumours present in the epithelium which are characterized by an increase in hippo signaling. This research shows the important of considering time of day when studying stem cells during homeostasis and in cancer. Funding Agencies CIHRNSERC

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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