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Enregistrement W3134007857 · doi:10.1101/2021.03.08.21252805

A human multisystem disorder with autoinflammation, leukoencephalopathy and hepatopathy is caused by mutations in <i>C2orf69</i>

2021· preprint· en· W3134007857 sur OpenAlexafffund
Eva Lausberg, Sebastian Gießelmann, Joseph P. Dewulf, Elsa Wiame, Anja Holz, Ramona Salvarinova, Clara van Karnebeek, Patricia Klemm, Kim Ohl, Michael Mull, Till Braunschweig, Joachim Weis, Clemens Sommer, Stephanie Demuth, Claudia M. Haase, François‐Guillaume Debray, Cécile Libioulle, Daniela Choukair, Prasad T. Oommen, Arndt Borkhardt, Harald Surowy, Dagmar Wieczorek, Robert Meyer, Thomas Eggermann, Matthias Begemann, Emile Van Schaftingen, Martin Häusler, Klaus Tenbrock, Lambert van den Heuvel, Miriam Elbracht, Ingo Kurth, Florian Kraft

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesRWTH Aachen UniversityDeutsche ForschungsgemeinschaftBC Children's Hospital
Mots-clésBiologyGeneTranscriptomeOpen reading frameMitochondrial respiratory chainGeneticsMitochondrionCell biologyGene expressionPeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Deciphering the function of the many genes previously classified as uncharacterized “open reading frame” (orf) completes our understanding of cell function and its pathophysiology. Methods Whole-exome sequencing, yeast 2-hybrid and transcriptome analyses together with molecular characterization are used here to uncover the function of the C2orf69 gene. Results We identify loss-of-function mutations in the uncharacterized C2orf69 gene in eight individuals with brain abnormalities involving hypomyelination and microcephaly, liver dysfunction and recurrent autoinflammation. C2orf69 contains an N-terminal signal peptide that is required and sufficient for mitochondrial localization. Consistent with mitochondrial dysfunction, patients show signs of respiratory chain defect and a CRISPR-Cas9 knockout cell model of C2orf69 shows comparable respiratory chain defects. Patient-derived cells reveal alterations in immunological signaling pathways. Deposits of PAS-positive material in tissues from affected individuals together with decreased glycogen branching enzyme 1 (GBE1) activity indicate an additional impact of C2orf69 on glycogen metabolism. Conclusion Our study identifies C2orf69 as an important regulator of human mitochondrial function and suggests an additional influence on other metabolic pathways. Graphical Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,089

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0270,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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