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Enregistrement W3134083417 · doi:10.1158/1538-7445.tme21-po006

Abstract PO006: Heating up the fight against cancer using 3D bioprinting

2021· article· en· W3134083417 sur OpenAlexaff
Anne-Marie Fortier, Erin E. Bedford, Salvador Flores Torres, Spiro Getsios, J. Matt Kinsella, Sam Wadsworth, Morag Park

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTumor microenvironmentImmune systemCancer-Associated FibroblastsImmunotherapyCancer researchCancer immunotherapyTumor-infiltrating lymphocytesCancerMedicineBiologyImmunologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Tumor growth is regulated by complex interactions of tumor cells with the tumor microenvironment (TME) which consists of cancer associated fibroblasts (CAFs), various immune cells including tumor infiltrating lymphocytes (TILs) and extracellular matrix components (1). Accurately modeling the TME in vitro is challenging as there is significant genetic (2, 3) and spatial (4) heterogeneity within TME components. Triple-negative breast cancer (TNBC) patients that have tumors with TILs restricted to the margins are called immune “cold” and have poor prognosis (5, 6). Interfering with the mechanisms that exclude TILs from these tumors may improve immunotherapy response and TNBC patient outcome. A major barrier to anti-cancer drug development is the availability of in vitro models that accurately reflect the in vivo TME. Our goal is to establish and validate a 3D bioprinted tumor model that reproduces the spatial relationship between tumor, CAFs and TILs. We have generated a biobank of TNBC patient-derived organoids and tissue-matched TME components. The tumor immune microenvironment molecular subtypes were assigned to each tumor sample using transcriptomic data and immunohistochemistry analysis. We have used microfluidic 3D bioprinting (RX1™ bioprinter, Aspect Biosystems) to print a core-shell fibre design that recapitulates the immune “cold” TME and permits monitoring of immune cell infiltration into the cancer cell core of the fibre. Clinically proven checkpoint inhibitor therapy will be applied to our model to validate its biological function. This innovative bioprinted tumor model will enable phenotypic screening to efficiently identify new targets that transform hard-to-treat immune “cold” tumors into a state where immune cells can infiltrate the tumor. Using patient-derived tissue-matched TME components increases the clinical relevance of the bioprinted tumor model and enables personalized anti-cancer drug screening in vitro to accurately predict patient response to therapy. 1. Balkwill FR, Capasso M, Hagemann T. The tumor microenvironment at a glance. J Cell Sci. 2012; 125: 5591-5596. 2. Finak G, Bertos N, Pepin F, et al. Stromal gene expression predicts clinical outcome in breast cancer. Nat Med. 2008; 14: 518-527. 3. Lehmann BD, Bauer JA, Chen X, et al. Identification of human triple-negative breast cancer subtypes and preclinical models for selection of targeted therapies. J Clin Invest. 2011; 121: 2750-2767. 4. Gruosso T, Gigoux M, Manem VSK, et al. Spatially distinct tumor immune microenvironments stratify triple-negative breast cancers. J Clin Invest. 2019;129(4):1785-1800. 5. Ali HR, Provenzano E, Dawson SJ, et al. Association between CD8+ T-cell infiltration and breast cancer survival in 12,439 patients. Ann Oncol. 2014; 25: 1536-1543. 6. Salgado R, Denkert C, Demaria S, et al. The evaluation of tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) in breast cancer: recommendations by an International TILs Working Group 2014. Ann Oncol. 2015; 26: 259-271. Citation Format: Anne-Marie Fortier, Erin Bedford, Salvador Flores Torres, Spiro Getsios, J. Matt Kinsella, Sam Wadsworth, Morag Park. Heating up the fight against cancer using 3D bioprinting [abstract]. In: Proceedings of the AACR Virtual Special Conference on the Evolving Tumor Microenvironment in Cancer Progression: Mechanisms and Emerging Therapeutic Opportunities; in association with the Tumor Microenvironment (TME) Working Group; 2021 Jan 11-12. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2021;81(5 Suppl):Abstract nr PO006.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,213
Tête enseignante GPT0,474
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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Résumé présentoui

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