Vac14 multimerization is required for Fab1 complex assembly and function
Notice bibliographique
Résumé
Phosphatidylinositol‐3,5‐bisphosphate (PtdIns3,5P 2 ) is a poorly understood regulator of endolysosome function. In yeast, PtdIns3,5P 2 is synthesized by the Fab1 PtdIns3P 5‐kinase and degraded by the antagonistic Fig4 phosphatase. Interestingly, Fab1 and Fig4 exist in a common protein complex containing Vac14. Vac14 is a self‐interacting protein necessary for Fab1 complex assembly. However, the exact function of Vac14 self‐interaction is not known, which we explore here. Size‐exclusion chromatography and velocity ultracentrifugation suggest that the Vac14 multimer is non‐globular and exists as a homodimer and/or homotrimer. Moreover, using sequential Vac14 truncations, site‐directed mutagenesis and co‐immunoprecipitation studies with both yeast and recombinant proteins, we identified several motifs in the C‐terminal half of Vac14 that are necessary for self‐interaction. Monomeric Vac14 mutants do not support interaction with Fab1 and Fig4, and consequently, did not rescue phenotypic defects in vac14Δ . Together, these results suggest that Vac14 multimerization is necessary and is the first step in the formation of the Fab1 complex and the synthesis of PtdIns3,5P 2 . Funded by NSERC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».