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Enregistrement W3134273611 · doi:10.3389/fvets.2021.643754

Real-Time Quaking-Induced Conversion Detection of PrPSc in Fecal Samples From Chronic Wasting Disease Infected White-Tailed Deer Using Bank Vole Substrate

2021· article· en· W3134273611 sur OpenAlexaboutno aff
Soyoun Hwang, Justin J. Greenlee, Eric M. Nicholson

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Veterinary Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésChronic wasting diseaseFecesBiologyIncubationTransmission (telecommunications)Veterinary medicineVirologyDiseasePrion proteinMicrobiologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic wasting disease (CWD) is a transmissible spongiform encephalopathy (TSE) that is fatal to free-range and captive cervids. CWD has been reported in the United States, Canada, South Korea, Norway, Finland, and Sweden, and the case numbers in both wild and farmed cervids are increasing rapidly. Studies indicate that lateral transmission of cervids likely occurs through the shedding of infectious prions in saliva, feces, urine, and blood into the environment. Therefore, the detection of CWD early in the incubation time is advantageous for disease management. In this study, we adapt real-time quacking-induced conversion (RT-QuIC) assays to detect the seeding activity of CWD prions in feces samples from clinical and preclinical white-tailed deer. By optimizing reaction conditions for temperature as well as the salt and salt concentration, prion seeding activity from both clinical and preclinical animals were detected by RT-QuIC. More specifically, all fecal samples collected from 6 to 30 months post inoculation showed seeding activity under the conditions of study. The combination of a highly sensitive detection tool paired with a sample type that may be collected non-invasively allows a useful tool to support CWD surveillance in wild and captive cervids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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