MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3134291788 · doi:10.1016/j.jbc.2021.100377

Can NAD(P)+ transhydrogenase (NNT) mediate a physiologically meaningful increase in energy expenditure by mitochondria during H2O2 removal?

2021· letter· en· W3134291788 sur OpenAlexaff
Tiago R. Figueira, Annelise Francisco, Jason R. Treberg, Roger F. Castilho

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2021
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNAD+ kinaseNicotinamideMitochondrionUbiquinolChemistryFlux (metallurgy)RedoxDehydrogenaseBiochemistryEnzymeCoenzyme Q – cytochrome c reductase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Smith et al. (1Smith C.D. Schmidt C.A. Lin C.-T. Fisher-Wellman K.H. Neufer P.D. Flux through mitochondrial redox circuits linked to nicotinamide nucleotide transhydrogenase generates counterbalance changes in energy expenditure.J. Biol. Chem. 2020; 295: 16207-16216Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (14) Google Scholar) studied skeletal muscle mitochondria (SMM) from different inbred mouse strains (C57BL/6NJ versus C57BL/6J; NNT function is absent in the latter) and concluded that NNT activity mediates meaningful increases in respiration when NADPH-dependent mitochondrial H2O2 removal is stimulated. To be valid, this contention requires the NNT reaction stoichiometry to be ∼200 H+ translocated per NAD(P) hydride transferred based on expected stoichiometries in mitochondrial respiration (at least 6H+:1O) and some of the authors’ reported values (1Smith C.D. Schmidt C.A. Lin C.-T. Fisher-Wellman K.H. Neufer P.D. Flux through mitochondrial redox circuits linked to nicotinamide nucleotide transhydrogenase generates counterbalance changes in energy expenditure.J. Biol. Chem. 2020; 295: 16207-16216Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (14) Google Scholar). The authors argued that NNT’s stoichiometry may be altered when the enzyme is generating NADPH (1Smith C.D. Schmidt C.A. Lin C.-T. Fisher-Wellman K.H. Neufer P.D. Flux through mitochondrial redox circuits linked to nicotinamide nucleotide transhydrogenase generates counterbalance changes in energy expenditure.J. Biol. Chem. 2020; 295: 16207-16216Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (14) Google Scholar), but a ratio of 200 H+ per hydride transfer challenges recent advances on the structure of NNT (2Leung J.H. Schurig-Briccio L.A. Yamaguchi M. Moeller A. Speir J.A. Gennis R.B. Stout C.D. Structural biology. Division of labor in transhydrogenase by alternating proton translocation and hydride transfer.Science. 2015; 347: 178-181Crossref PubMed Scopus (29) Google Scholar, 3Kampjut D. Sazanov L.A. Structure and mechanism of mitochondrial proton-translocating transhydrogenase.Nature. 2019; 573: 291-295Crossref PubMed Scopus (32) Google Scholar), which provide strong evidence these two molecular events are tightly coupled with a ratio of 1:1. Smith et al. (1Smith C.D. Schmidt C.A. Lin C.-T. Fisher-Wellman K.H. Neufer P.D. Flux through mitochondrial redox circuits linked to nicotinamide nucleotide transhydrogenase generates counterbalance changes in energy expenditure.J. Biol. Chem. 2020; 295: 16207-16216Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (14) Google Scholar) assert NADPH-dependent H2O2 removal can be linked to respiration by adding auranofin plus bis-chloroethylnitrosourea to mitochondria. However, these compounds caused similar decreases (∼35%, see Fig. 4D (1Smith C.D. Schmidt C.A. Lin C.-T. Fisher-Wellman K.H. Neufer P.D. Flux through mitochondrial redox circuits linked to nicotinamide nucleotide transhydrogenase generates counterbalance changes in energy expenditure.J. Biol. Chem. 2020; 295: 16207-16216Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (14) Google Scholar)) in O2 consumption in both mouse strains, indicating suppression of respiration irrespective of NNT flux and making conclusions based on these inhibitors ambiguous. Finally, previous studies comparing mitochondria from mice with or without functional NNT (using genetically closer controls) found no evidence of NNT-mediated flux sufficient to be measured as increased respiration (4Parker N. Crichton P.G. Vidal-Puig A.J. Brand M.D. Uncoupling protein-1 (UCP1) contributes to the basal proton conductance of brown adipose tissue mitochondria.J. Bioenerg. Biomembr. 2009; 41: 335-342Crossref PubMed Scopus (47) Google Scholar, 5Ronchi J.A. Francisco A. Passos L.A.C. Figueira T.R. Castilho R.F. The contribution of nicotinamide nucleotide transhydrogenase to peroxide detoxification is dependent on the respiratory state and counterbalanced by other sources of NADPH in liver mitochondria.J. Biol. Chem. 2016; 291: 20173-20187Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (62) Google Scholar). While the findings of Smith et al. (1Smith C.D. Schmidt C.A. Lin C.-T. Fisher-Wellman K.H. Neufer P.D. Flux through mitochondrial redox circuits linked to nicotinamide nucleotide transhydrogenase generates counterbalance changes in energy expenditure.J. Biol. Chem. 2020; 295: 16207-16216Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (14) Google Scholar) are attractive, we contend more direct evidence is needed before the role of redox circuits through NNT can be definitively understood in the context of energy expenditure. The authors declare that they have no conflicts of interest with the contents of this article.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetMitochondrial Function and PathologyTravaux en français237 207