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Enregistrement W3134634424 · doi:10.1093/jacamr/dlab003

Antimicrobial resistance among uropathogens in the Asia-Pacific region: a systematic review

2021· review· en· W3134634424 sur OpenAlexaboutno aff
Adhi Kristianto Sugianli, Franciscus Ginting, Ida Parwati, M.C.M. de Jong, Frank van Leth, Constance Schultsz

Notice bibliographique

RevueJAC-Antimicrobial Resistance · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrinary Tract Infections Management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKoninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen
Mots-clésAntibiotic resistanceMedicineNitrofurantoinPopulationTrimethoprimPrevalenceAntimicrobialEnvironmental healthAntibioticsBiologyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Antimicrobial resistance (AMR) in urinary tract infections (UTI) is a global public health problem. However, estimates of the prevalence of AMR, required for empirical treatment guidelines, are lacking for many regions. OBJECTIVES: , the two priority uropathogens, in the Asia-Pacific region (APAC). METHODS: PubMed, EBSCO and Web of Science databases were searched for articles (2008-20), following PRISMA guidelines. The prevalence of resistance was calculated and reported as point estimate with 95% CI for antimicrobial drugs recommended in WHO treatment guidelines. Data were stratified by country and surveillance approach (laboratory- or population-based surveillance). The quality of included articles was assessed using a modified Newcastle-Ottawa Quality Assessment Scale. RESULTS: Out of 2400 identified articles, 24 studies, reporting on 11 (26.8%) of the 41 APAC countries, met the inclusion criteria. Prevalence of resistance against trimethoprim/sulfamethoxazole, ciprofloxacin, and ceftriaxone ranged between 33% and 90%, with highest prevalence reported from Bangladesh, India, Sri Lanka and Indonesia. Resistance against nitrofurantoin ranged between 2.7% and 31.4%. Two studies reported data on fosfomycin resistance (1.8% and 1.7%). Quality of reporting was moderate. CONCLUSIONS: We show very high prevalence estimates of AMR against antibiotics commonly used for the empirical treatment of UTI, in the limited number of countries in the APAC for which data are available. Novel feasible and affordable approaches that facilitate population-based AMR surveillance are needed to increase knowledge on AMR prevalence across the region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,006
Bibliométrie0,0130,017
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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