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Enregistrement W3134660083 · doi:10.1094/phyto-10-20-0469-r

The Changing Virulence of Stripe Rust in Canada from 1984 to 2017

2021· article· en· W3134660083 sur OpenAlex
Kaveh Ghanbarnia, Ryan Gourlie, Eric Amundsen, Reem Aboukhaddour

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesWestern Grains Research Foundation
Mots-clésVirulenceBiologyRust (programming language)Stripe rustGeneticsPlant disease resistanceGeneComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stripe rust, caused by the fungal pathogen Puccinia striiformis f. sp. tritici, is an important wheat disease worldwide. In this study, the P. striiformis f. sp. tritici population in Canada, representing a time period from 1984 to 2017, was analyzed for virulence diversity and geographical distribution. Virulence of 140 P. striiformis f. sp. tritici isolates was evaluated on 17 near-isogenic wheat lines in the ‘Avocet S’ background, each containing a single resistance gene along with an 18th line ‘Tyee’. Seedlings were inoculated with a urediniospore/talc mixture and infection types were evaluated on a scale of 0 to 9. In total, 89 races were identified with various combinations of defeated Yr genes. Clear changes in pathogen virulence have been observed through time that are confirmed by clustering algorithms. The results showed that the tested P. striiformis f. sp. tritici isolates remained avirulent on Yr1, Yr5, and Yr15, and have very low frequency of virulence on Yr76, but had high frequencies of virulence on Yr6, Yr7, Yr8, Yr9, Yr17, Yr43, Yr44, YrTr1, and YrExp2. P. striiformis f. sp. tritici virulence spiked on Yr7, Yr8, and Yr9 for the first time in 2000, and on Yr10 and Yr27 in 2010. Overall, the predominant races in Canada were very similar to those reported in the United States (PSTv-37, PSTv-41, and PSTv-52), which indicates long-distance migration of P. striiformis f. sp. tritici from the United States to Canada. Sixty-four races had unique virulence combinations that had not been previously reported in the United States, which suggested that evolution of virulence/avirulence for host resistance by mutation at local scale, is possible. Analysis of diversity between Canadian isolates and races from the United States since 2010 showed that the P. striiformis f. sp. tritici population in western Canada is similar to that in the western states of the United States, and that the population in eastern Canada is similar to the eastern and/or central regions of the United States, supporting the hypothesis that specific P. striiformis f. sp. tritici populations in North America travel through different wind trajectories.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,645
Score d'incertitude au seuil0,944

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle