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Enregistrement W3134850267 · doi:10.1101/2021.03.01.433433

Distinct sub-cellular autophagy impairments occur independently of protein aggregation in induced neurons from patients with Huntington’s disease

2021· preprint· en· W3134850267 sur OpenAlexafffund
Karolina Pircs, Janelle Drouin‐Ouellet, Jeovanis Gil, Melinda Rezeli, Daniela A. Grassi, Raquel Garza, Yogita Sharma, Isabelle St‐Amour, Marie E. Jönsson, Pia A. Johansson, Kate Harris, Romina Vuono, Thomas B. Stoker, Bob A. Hersbach, Kritika Sharma, Jessica Lagerwall, Stina Lagerström, Petter Storm, Vivien Horváth, Sébastien S. Hébert, György Marko‐Varga, Malin Parmar, Roger A. Barker, Johan Jakobsson

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversité LavalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNIHR Cambridge Biomedical Research CentreScience for Life LaboratoryVetenskapsrådetStiftelsen Lars Hiertas MinneWellcome TrustCrafoordska StiftelsenDepartment of Health and Social CareFondation pour la Recherche MédicaleStiftelsen Olle Engkvist ByggmästareNational Institute for Health and Care ResearchFonds de Recherche du Québec - SantéThorsten och Elsa Segerfalks Stiftelse
Mots-clésAutophagyHuntingtinNeuriteReprogrammingGene silencingHuntington's diseaseBiologyNeuroscienceCell biologySomaNeurodegenerationDiseaseMedicineGeneGeneticsPathologyIn vitroApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Huntington’s disease (HD) is a neurodegenerative disorder caused by CAG expansions in the huntingtin (HTT) gene. Modelling HD has remained challenging, as rodent and cellular models poorly recapitulate the disease. To address this, we generated induced neurons (iNs) through direct reprogramming of human skin fibroblasts, which retain age-dependent epigenetic characteristics. HD-iNs displayed profound deficits in autophagy, characterised by reduced transport of late autophagic structures from the neurites to the soma. The neurite-specific alterations in autophagy resulted in shorter, thinner and fewer neurites presented by HD-iNs. CRISPRi-mediated silencing of HTT did not rescue this phenotype but rather resulted in additional autophagy alterations in ctrl-iNs, highlighting the importance of wild type HTT in neuronal autophagy. In summary, our work identifies a distinct subcellular autophagy impairment in aged patient derived HD-neurons and provides a new rational for future development of autophagy activation therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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