Comparative bioacoustics: a roadmap for quantifying and comparing animal sounds across diverse taxa
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Notice bibliographique
Résumé
Animals produce a wide array of sounds with highly variable acoustic structures. It is possible to understand the causes and consequences of this variation across taxa with phylogenetic comparative analyses. Acoustic and evolutionary analyses are rapidly increasing in sophistication such that choosing appropriate acoustic and evolutionary approaches is increasingly difficult. However, the correct choice of analysis can have profound effects on output and evolutionary inferences. Here, we identify and address some of the challenges for this growing field by providing a roadmap for quantifying and comparing sound in a phylogenetic context for researchers with a broad range of scientific backgrounds. Sound, as a continuous, multidimensional trait can be particularly challenging to measure because it can be hard to identify variables that can be compared across taxa and it is also no small feat to process and analyse the resulting high-dimensional acoustic data using approaches that are appropriate for subsequent evolutionary analysis. Additionally, terminological inconsistencies and the role of learning in the development of acoustic traits need to be considered. Phylogenetic comparative analyses also have their own sets of caveats to consider. We provide a set of recommendations for delimiting acoustic signals into discrete, comparable acoustic units. We also present a three-stage workflow for extracting relevant acoustic data, including options for multivariate analyses and dimensionality reduction that is compatible with phylogenetic comparative analysis. We then summarize available phylogenetic comparative approaches and how they have been used in comparative bioacoustics, and address the limitations of comparative analyses with behavioural data. Lastly, we recommend how to apply these methods to acoustic data across a range of study systems. In this way, we provide an integrated framework to aid in quantitative analysis of cross-taxa variation in animal sounds for comparative phylogenetic analysis. In addition, we advocate the standardization of acoustic terminology across disciplines and taxa, adoption of automated methods for acoustic feature extraction, and establishment of strong data archival practices for acoustic recordings and data analyses. Combining such practices with our proposed workflow will greatly advance the reproducibility, biological interpretation, and longevity of comparative bioacoustic studies.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle