MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3135180819 · doi:10.1128/9781555819569.ch26

Epigenetic Phosphorylation Control of<i>Mycobacterium tuberculosis</i>Infection and Persistence

2017· book-chapter· en· W3135180819 sur OpenAlexaff
Melissa Richard‐Greenblatt, Yossef Av‐Gay

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2017
Typebook-chapter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophosphorylationHistidine kinaseResponse regulatorPhosphorylationBiologyKinaseBiochemistryThreonineTwo-component regulatory systemPhosphorylation cascadeCell biologyHistidineProtein kinase AProtein phosphorylationSerineMutantAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein phosphorylation is known to occur across all three kingdoms of life; however, the study of posttranslational modification in bacteria was neglected for a considerable amount of time. Early attempts to detect its presence were unsuccessful, generating the dogma that protein phosphorylation was a regulatory mechanism that emerged late in evolution to meet the needs of organisms composed of multiple and differentiated cells. The pioneering work of several groups in the 1970s identified protein kinase activity in both Escherichia coli and Salmonella typhimurium (1 – 3), which soon led to the discovery of the histidine/aspartate kinases of the two-component systems (4, 5). The first aspect of this system involves the stimulation of a histidine kinase by a particular environmental or intracellular signal resulting in autophosphorylation on a key histidine residue. The phospho-histidine can then be used as a substrate by the cognate response regulator for its own autophosphorylation on an aspartate residue. The majority of response regulators are DNA binding proteins that trigger expression from target promoters. Unlike the cross-reactivity observed with serine/threonine/tyrosine (Ser/Thr/Tyr) kinases in eukaryotic cell signaling cascades, two-component systems work in isolation, where a given pairing of histidine kinase and response regulator is highly selective for each other via protein-protein interaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueASM Press eBooksMême sujetTuberculosis Research and EpidemiologyTravaux en français237 207