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Enregistrement W3135187287 · doi:10.1101/2021.03.02.21252685

Testing Black-White disparities in biological aging in older adults in the United States: analysis of DNA-methylation and blood-chemistry methods

2021· preprint· en· W3135187287 sur OpenAlexfundno aff
Gloria Huei-Jong Graf, Christopher L. Crowe, Meeraj Kothari, Dayoon Kwon, Jennifer J. Manly, Indira C. Turney, Linda Valeri, Daniel W. Belsky

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthJacobs FoundationCanadian Institute for Advanced ResearchSage Foundation
Mots-clésDNA methylationGerontologyBiological ageWhite (mutation)Healthy agingMedicineMethylationGeneticsBiologyDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Biological aging is a proposed mechanism through which social determinants drive health disparities. We conducted proof-of-concept testing of eight DNA-methylation and blood-chemistry quantifications of biological aging as mediators of disparities in healthspan between Black and White participants in the United States Health and Retirement Study (HRS; n=9005). We quantified biological aging from four DNA-methylation “clocks” (Horvath, Hannum, PhenoAge, and GrimAge), a DNA-methylation Pace of Aging (DunedinPoAm), and three blood-chemistry measures (PhenoAge, Klemera-Doubal method Biological Age, and homeostatic dysregulation). We quantified Black-White disparities in healthspan from cross-sectional and longitudinal data on physical-performance tests, self-reported activities of daily living (ADL) limitations and physician-diagnosed chronic diseases, self-rated health, and survival. DNA-methylation and blood-chemistry quantifications of biological aging were moderately correlated (Pearson-r range 0.1-0.4). GrimAge, DunedinPoAm and all three blood-chemistry measures were associated with healthspan characteristics (e.g. mortality effect-size range 1.71-2.32) and showed evidence of more advanced/faster biological aging in Black compared with White participants (Cohen’s d=.4-.5). These measures accounted for 13-95% of Black-White differences in healthspan-related characteristics. Findings that Black Americans are biologically older and aging more rapidly than White Americans of the same chronological age suggest that eliminating disparities in the pace of aging can contribute building to aging health equity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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