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Enregistrement W3135232272 · doi:10.1002/hep.31787

Impact of Genotype, Serum Bile Acids, and Surgical Biliary Diversion on Native Liver Survival in FIC1 Deficiency

2021· article· en· W3135232272 sur OpenAlexaff
Daan van Wessel, Richard J. Thompson, Emmanuel Gonzalès, Irena Jankowska, Benjamin L. Shneider, Étienne Sokal, Tassos Grammatikopoulos, Agustina Kadaristiana, Emmanuel Jacquemin, Anne Spraul, Patryk Lipiński, Piotr Czubkowski, Nathalie Rock, Mohammad Shagrani, Dieter C. Bröering, Talal Algoufi, Nejat Mazhar, Emanuele Nicastro, Déirdre Kelly, Gabriella Nebbia, Henrik Arnell, Björn Fischler, Jan B.F. Hulscher, Daniele Serranti, Çiğdem Arıkan, Dominique Debray, Florence Lacaille, Cristina Gonçalves, Loreto Hierro, Gema Muñoz Bartolo, Yael Mozer‐Glassberg, Amer Azaz, Jernej Brecelj, Antal Dezsőfi, Pier Luigi Calvo, Dorothée Krebs-Schmitt, Steffen Hartleif, Wendy L. van der Woerd, Jianshe Wang, Liting Li, Özlem Durmaz, Nanda Kerkar, Marianne Hørby Jørgensen, Ryan Fischer, Carolina Jiménez‐Rivera, Seema Alam, Mara Cananzi, Noémie Laverdure, Cristina Targa Ferreira, Felipe Ordonez, Heng Wang, Valerie Sency, Kyung Mo Kim, Huey‐Ling Chen, Elisa de Carvalho, Alexandre Fabre, Estella M. Alonso, Ronald J. Sokol, Frederick J. Suchy, Kathleen M. Loomes, Patrick McKiernan, Philip Rosenthal, Yumirle P. Turmelle, Girish S. Rao, Simon Horslen, Binita M. Kamath, Maria Rogalidou, Wikrom Karnsakul, Bettina E. Hansen, Henkjan J. Verkade

Notice bibliographique

RevueHepatology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity Health NetworkSickKids FoundationUniversity of TorontoChildren's Hospital of Eastern OntarioHospital for Sick ChildrenUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesRijksuniversiteit GroningenAudentes TherapeuticsNational Institutes of HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSeattle Children's Research InstituteGilead Sciences
Mots-clésGenotypeGastroenterologyMedicineInternal medicineGeneral surgeryBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: Mutations in ATPase phospholipid transporting 8B1 (ATP8B1) can lead to familial intrahepatic cholestasis type 1 (FIC1) deficiency, or progressive familial intrahepatic cholestasis type 1. The rarity of FIC1 deficiency has largely prevented a detailed analysis of its natural history, effects of predicted protein truncating mutations (PPTMs), and possible associations of serum bile acid (sBA) concentrations and surgical biliary diversion (SBD) with long-term outcome. We aimed to provide insights by using the largest genetically defined cohort of patients with FIC1 deficiency to date. APPROACH AND RESULTS: This multicenter, combined retrospective and prospective study included 130 patients with compound heterozygous or homozygous predicted pathogenic ATP8B1 variants. Patients were categorized according to the number of PPTMs (i.e., splice site, frameshift due to deletion or insertion, nonsense, duplication), FIC1-A (n = 67; no PPTMs), FIC1-B (n = 29; one PPTM), or FIC1-C (n = 34; two PPTMs). Survival analysis showed an overall native liver survival (NLS) of 44% at age 18 years. NLS was comparable among FIC1-A, FIC1-B, and FIC1-C (% NLS at age 10 years: 67%, 41%, and 59%, respectively; P = 0.12), despite FIC1-C undergoing SBD less often (% SBD at age 10 years: 65%, 57%, and 45%, respectively; P = 0.03). sBAs at presentation were negatively associated with NLS (NLS at age 10 years, sBAs < 194 µmol/L: 49% vs. sBAs ≥ 194 µmol/L: 15%; P = 0.03). SBD decreased sBAs (230 [125-282] to 74 [11-177] μmol/L; P = 0.005). SBD (HR 0.55, 95% CI 0.28-1.03, P = 0.06) and post-SBD sBA concentrations < 65 μmol/L (P = 0.05) tended to be associated with improved NLS. CONCLUSIONS: Less than half of patients with FIC1 deficiency reach adulthood with native liver. The number of PPTMs did not associate with the natural history or prognosis of FIC1 deficiency. sBA concentrations at initial presentation and after SBD provide limited prognostic information on long-term NLS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,443

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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