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Enregistrement W3135441894 · doi:10.1093/jcag/gwab002.030

A31 COMPLEX ROLE OF DIETARY FIBERS IN IBD: MICROBES MEDIATE FIBER-INDUCED INFLAMMATION

2021· article· en· W3135441894 sur OpenAlexaff
Heather Armstrong, Rosica Valcheva, Deanna M. Santer, Zhengxiao Zhang, Aja M. Rieger, Stephanie Dijk, R Dickner, Jeremy Jerasi, I K Mander, France Moreau, Hayley Gorman, D Lafleur, Juan Jovel, A Petrova, Kris Chadee, Matthew Carroll, Hien Q. Huynh, Karen Madsen, Levinus A. Dieleman, Eytan Wine

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmune systemEx vivoInflammatory bowel diseaseIn vivoInflammationImmunologyMicrobiologyGut floraReceptorUlcerative colitisBiologyChemistryMedicineInternal medicineDiseaseBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Dietary fibers pass through the bowel undigested and are fermented within the intestine by microbes, typically promoting gut health. However, many IBD patients describe experiencing sensitivity to fibers. β-glucan, found on the surface of fungal cells during fungal infection, has been shown to bind to fiber receptors, such as Dectin-1, on host immune cells, resulting in a pro-inflammatory response. These fungal fibres share properties with dietary fibers. Aims As an altered gut microbial composition has been associated with IBD, we hypothesized that the loss of fiber-fermenting microbes populating the gut in IBD could lead to dietary fibers not being efficiently broken down into their beneficial biproducts (e.g. short chain fatty acids; SCFA), resulting in binding of intact fibers to pro-inflammatory host cell receptors. Methods Immune and epithelial cell lines and colonic biopsies cultured ex vivo were incubated with oligofructose or inulin (5g/L), or pre-fermented fibers (24hr anaerobic fermentation). Immune responses were measured by cytokine secretion (ELISA), and expression (qPCR). Barrier integrity was measured by transepithelial resistance (TEER). Food frequency questionnaire (FFQ) data of patient fiber consumption were correlated with gut microbes (shotgun sequencing) and immune responses to fiber in patient biopsies. Results Unfermented oligofructose induced IL-1β secretion in leukocytes (macrophage, T cell, neutrophil) and in colon biopsies from pediatric Crohn disease (CD; n=38) and ulcerative colitis (UC; n=20) patients cultured ex vivo, but not in non-IBD patients (n=21). IL-1β secretion was greater in patients with more severe disease. Pre-fermentation of oligofructose by whole-microbe intestinal washes from non-IBD patients or remission patients reduced secretion of IL-1β, while whole microbe intestinal washes from severe IBD patients were unable to ferment oligofructose or reduce cytokine secretion. Fiber effects on IL-1β secretion in biopsies positively correlated with effects on barrier integrity in T84 cells. Fiber-associated immune responses in patient biopsies cultured ex vivo (ELISA) correlated with fiber avoidance (FFQ) and gut microbiome (sequencing) in matching patient samples. Conclusions Our findings demonstrate that intolerance and avoidance of prebiotic fibers in select IBD patients is associated with the inability to ferment these fibers, leading to pro-inflammatory immune responses and intestinal barrier disruption. This highlights select disease state scenarios, in which administration of fermentable fibers should be avoided and tailored dietary interventions should be considered in IBD patients. Funding Agencies CIHRWeston Foundation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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