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Enregistrement W3135557210 · doi:10.1038/s41436-021-01119-8

Clinical delineation, sex differences, and genotype–phenotype correlation in pathogenic KDM6A variants causing X-linked Kabuki syndrome type 2

2021· article· en· W3135557210 sur OpenAlexaff
Víctor Faùndes, Stephanie Goh, Rhoda Akilapa, Heidre Bezuidenhout, Hans T. Björnsson, Lisa Bradley, Angela F. Brady, Elise Brischoux‐Boucher, Han G. Brunner, Saskia Bulk, Natalie Canham, Declan Cody, Maria Lisa Dentici, M. Cristina Digilio, Frances Elmslie, Andrew E. Fry, Harinder Gill, Jane A. Hurst, Diana Johnson, Sophie Julia, Katherine Lachlan, Robert Roger Lebel, Melissa Byler, Eric Gershon, Edmond G. Lemire, Maria Gnazzo, Francesca Romana Lepri, Antonia Marchèse, Meriel McEntagart, Julie McGaughran, Seiji Mizuno, Nobuhiko Okamoto, Claudine Rieubland, Jonathan Rodgers, Erina Sasaki, Emmanuel Scalais, Ingrid Scurr, Mohnish Suri, Ineke van der Burgt, Naomichi Matsumoto, Noriko Miyake, Valérie Benoît, Damien Lederer, Siddharth Banka

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanRoyal University Hospital
Organismes subventionnairesComisión Nacional de Investigación Científica y TecnológicaJapan Society for the Promotion of ScienceMinistero della SaluteNational Institute for Health and Care ResearchWellcome TrustJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésPhenotypeKabukiGenotypeGeneticsBiologyCorrelationKabuki syndromeGenotype-phenotype distinctionMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The variant spectrum and the phenotype of X-linked Kabuki syndrome type 2 (KS2) are poorly understood. METHODS: Genetic and clinical details of new and published individuals with pathogenic KDM6A variants were compiled and analyzed. RESULTS: Sixty-one distinct pathogenic KDM6A variants (50 truncating, 11 missense) from 80 patients (34 males, 46 females) were identified. Missense variants clustered in the TRP 2, 3, 7 and Jmj-C domains. Truncating variants were significantly more likely to be de novo. Thirteen individuals had maternally inherited variants and one had a paternally inherited variant. Neonatal feeding difficulties, hypoglycemia, postnatal growth retardation, poor weight gain, motor delay, intellectual disability (ID), microcephaly, congenital heart anomalies, palate defects, renal malformations, strabismus, hearing loss, recurrent infections, hyperinsulinism, seizures, joint hypermobility, and gastroesophageal reflux were frequent clinical findings. Facial features of over a third of patients were not typical for KS. Males were significantly more likely to be born prematurely, have shorter stature, and severe developmental delay/ID. CONCLUSION: We expand the KDM6A variant spectrum and delineate the KS2 phenotype. We demonstrate that the variability of the KS2 phenotypic depends on sex and the variant type. We also highlight the overlaps and differences between the phenotypes of KS2 and KS1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,554

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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