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Enregistrement W3135841314 · doi:10.1073/pnas.2025638118

The cyanobacterium <i>Prochlorococcus</i> has divergent light-harvesting antennae and may have evolved in a low-oxygen ocean

2021· article· en· W3135841314 sur OpenAlexafffund
Osvaldo Ulloa, Carlos Henríquez‐Castillo, Salvador Ramírez‐Flandes, Álvaro M. Plominsky, Alejandro A. Murillo, Connor Morgan‐Lang, Steven Hallam, Ramūnas Stepanauskas

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensGenome British ColumbiaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesHakai InstituteAgouron InstituteNational Science Foundation
Mots-clésProchlorococcusCyanobacteriaPhotosynthesisBiologyEcotypeBotanyNutrientSynechococcusEcologyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance The marine unicellular cyanobacterium Prochlorococcus is the most abundant photosynthetic organism on Earth. Members of this genus are classically thought to be adapted to high-oxygen and nutrient-poor ocean conditions, with a principle divergence between high-light and low-light ecotypes. We show that the most basal Prochlorococcus lineages are adapted to the low-oxygen, low-light, and high-nutrient conditions found in the dimly illuminated waters of anoxic marine zones. The most basal lineages have retained phycobilisomes as light-harvesting antennae—a characteristic of most other cyanobacteria—whose loss was thought to define all Prochlorococcus . As oxygenic photosynthesis drove ocean oxidation in the ancient Earth, oxygen appears to have played as much a role as light and nutrients in driving Prochlorococcus evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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