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Enregistrement W3136102254 · doi:10.33943/mms.2021.60.50.003

POLYMORPHISM OF THE BETA-CASEIN GENE IN HOLSTEIN COWS

2021· article· ru· W3136102254 sur OpenAlexaboutno aff
Л.В. КАЛАШНИКОВА, В.Г. Труфанов, Я.А. ХАБИБРАХМАНОВА, Т.Б. ГАНЧЕНКОВА, N. V. Ryzhova, И.Ю. ПАВЛОВА

Notice bibliographique

RevueMolochnoe i miasnoe skotovodstvo · 2021
Typearticle
Langueru
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAllele frequencyHerdAlleleGenotypeGenotype frequencyAnimal sciencePopulationBiologyPolymorphism (computer science)GeneticsGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Представлены результаты исследований частоты встречаемости аллельных вариантов А1 и А2 гена бета-казеина (CSN2) у животных голштинской породы (n=510), принадлежащих пяти племенным хозяйствам Российской Федерации. Анализ ДНК проводился методом полимеразной цепной реакции с искусственно созданным сайтом рестрикции (ACRS-ПЦР). В среднем, по всему исследованному поголовью частота генотипов составила: A1A1—15% (n=78), A1A2—41 % (n=210), A2A2—44% (n=222). Частота желательного аллельного варианта А2 в среднем по всем стадам достигла 0,641 и превысила частоту аллеля А1 (0,359). Генотип А2А2 чаще встречается в группе племенных животных, импортированных из Дании. Им обладают 77% особей из 40 исследованных. Частота аллеля А2 в стаде исследуемого племенного хозяйства Курской области в 7 раз превысила частоту аллеля А1 и достигла 0,875. На 2-ом месте по частоте аллеля А2 находится маточное поголовье, завезенное из США. В племенном хозяйстве Московской области 42% животных из 354 исследованных имеют желательный генотип А2А2, частота аллеля А2 составила 0,640. В Камчатском крае отмечена сходная частота аллеля А2 (0,635) у племенных особей голштинской породы североамериканской селекции. В группе скота венгерской селекции, принадлежащей племенному хозяйству Рязанской области, частота аллеля А2 гена CSN2 ниже (0,611). В другом хозяйстве этого региона у голштинской породы канадского происхождения частота аллеля А1 (0,522) превысила частоту аллеля А2 (0,478). По исследованному поголовью оценки наблюдаемой (Ho) и ожидаемой (He) гетерозиготности имеют сходные значения и составляют 0,430 и 0,460 соответственно. The results of studies of the frequency of occurrence of allelic variants A1 and A2 of the beta-casein gene (CSN2) in Holstein animals (n=510) belonging to five breeding farms of the Russian Federation are presented. DNA analysis was performed by polymerase chain reaction with an artificially created restriction site (ACRS-PCR). On average, the frequency of genotypes for the entire studied population was: A1A1-15% (n=78), A1A2—41% (n=210), A2A2—44% (n=222). The frequency of the desired A2 allele variant reached 0.641 on average across all herds and exceeded the frequency of the A1 allele (0.359). The A2A2 genotype is more common in a group of breeding animals imported from Denmark. It is possessed by 77% of the 40 individuals studied. The frequency of the A2 allele in the herd of the studied breeding farm of the Kursk region was 7 times higher than the frequency of the A1 allele and reached 0.875. On the 2nd place in the frequency of the A2 allele is the breeding stock imported from the United States. In the breeding farm of the Moscow region, 42% of the 354 animals studied have the desired genotype A2A2, the frequency of the A2 allele was 0.640. In the Kamchatka Territory, a similar frequency of the A2 allele (0.635) was observed in cows of the Holstein breed of North American selection. In the group of Hungarian-bred cattle belonging to the Ryazan Region breeding farm, the frequency of the A2 allele of the CSN2 gene is lower (0.611). In another farm in this region, the Holstein breed of Canadian origin had the frequency of the A1 allele (0.522) higher than the frequency of the A2 allele (0.478). For the studied livestock, the estimates of observed (Ho) and expected (He) heterozygosity have similar values and are 0.430 and 0.460, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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