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Enregistrement W3136149963

Characterization of Genetic Sources Associated with Restorability and Seed Dimension in Arkansas Restorer Rice Lines

2020· article· en· W3136149963 sur OpenAlexaboutno aff
Ozgur Azapoglu

Notice bibliographique

RevueJournal of the Arkansas Academy of Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRice Cultivation and Yield Improvement
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDimension (graph theory)BiologyBiotechnologyMathematics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hybrid rice (Oryza sativa L.) breeding offers a significant opportunity to enhance rice production, and the cultivation of a male sterile line is the most important factor in the success of cross-breeding. One of the key elements of hybrid rice production is to develop a restorer line that is assigned as the male parent. The restorer lines provide viable pollen for fertilization of the male sterile plant due to the presence of a restorer gene (Rf) in their genomes. Any superior restorer line applied to hybrid rice production must contain genes/quantitative trait loci (QTL) associated with the desirable agronomic traits in its genome. The objectives in this study were to 1) identify the genetic source of restorability in two Arkansas-developed restorer lines, 367R and 396R, and 2) identify QTLs associated with seed dimensions in two restorer lines. The study was performed at the University of Arkansas System Division of Agriculture, Rice Research and Extension Center, Stuttgart, Arkansas. Three populations resulting from crosses between 367R and Arkansas advanced lines RU1501139, and 396R crossed with Tropical Japonica cultivar “Newbonnet (PI474580) or Arkansas advanced line RU1501047 were developed. Five F3 plants from each F2:3 line were selected for testcross with an Arkansas developed cytoplasmic male sterile (CMS) line 873A. Five testcross F1 plants resulting from each selected pollen donor plant were grown in the greenhouse. Pollen fertility was tested via a pollen stain procedure (Virmani et al, 1997). The results showed that 367R contains one restorer gene and 396R possesses two restorer genes within their genomes. The genotypic analysis showed that there are two major QTLs, in chromosome (“chr” hereafter) 10, which is co-localized with two previously reported QTLs where Rf4 and Rf5 genes were mapped. For the second part of this study, the parental lines were evaluated for grain length, width, thickness, 100-seed weight, and heading date. The population 367R × RU1501139 (“Population-A”, hereafter) was selected for evaluation of grain length, thickness, and length/width ratio. A total of 300 F3 seeds from F2 plants grown in greenhouse conditions were harvested, cleaned and evaluated using the WinSEEDLE TM image analyzer (Regent Instruments Inc., Canada). A total of 17 QTLs for grain dimensions were identified. Two QTLs in chr. 3 and one each QTL in chr. 7 and 11 were associated with grain length, while two QTLs located in chrs. 3 and 7 were associated with grain length/width ratio. Three QTLs located in chrs. 5, 6, and 8 were associated with grain thickness, while nine grain weight QTLs were identified that included four QTLs in chr. 12, two QTLs in chrs. 1 and 10, and one QTL in chr. 3. These results can be used for developing superior restorer lines and applied to hybrid rice production via marker-assisted selection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,748
Score d'incertitude au seuil0,153

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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