Characterization of the Ergosterol Biosynthesis Pathway in Ceratocystidaceae
Notice bibliographique
Résumé
Terpenes represent the biggest group of natural compounds on earth. This large class of organic hydrocarbons is distributed among all cellular organisms, including fungi. The different classes of terpenes produced by fungi are mono, sesqui, di- and triterpenes, although triterpene ergosterol is the main sterol identified in cell membranes of these organisms. The availability of genomic data from members in the Ceratocystidaceae enabled the detection and characterization of the genes encoding the enzymes in the mevalonate and ergosterol biosynthetic pathways. Using a bioinformatics approach, fungal orthologs of sterol biosynthesis genes in nine different species of the Ceratocystidaceae were identified. Ergosterol and some of the intermediates in the pathway were also detected in seven species (Ceratocystis manginecans, C. adiposa, Huntiella moniliformis, Thielaviopsis punctulata, Bretziella fagacearum, Endoconidiophora polonica and Davidsoniella virescens), using gas chromatography-mass spectrometry analysis. The average ergosterol content differed among different genera of Ceratocystidaceae. We also identified all possible terpene related genes and possible biosynthetic clusters in the genomes used in this study. We found a highly conserved terpene biosynthesis gene cluster containing some genes encoding ergosterol biosynthesis enzymes in the analysed genomes. An additional possible terpene gene cluster was also identified in all of the Ceratocystidaceae. We also evaluated the sensitivity of the Ceratocystidaceae to a triazole fungicide that inhibits ergosterol synthesis. The results showed that different members of this family behave differently when exposed to different concentrations of triazole tebuconazole.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».