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Enregistrement W3136407982 · doi:10.1002/acr.24601

Machine Learning–Based Individualized Survival Prediction Model for Total Knee Replacement in Osteoarthritis: Data From the Osteoarthritis Initiative

2021· article· en· W3136407982 sur OpenAlexafffund
Afshin Jamshidi, Jean‐Pierre Pelletier, Aurélie Labbe, F. Abram, Johanne Martel‐Pelletier, Arnaud Droit

Notice bibliographique

RevueArthritis Care & Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTotal Knee Arthroplasty Outcomes
Établissements canadiensCentre hospitalier de l'Université LavalHEC MontréalUniversité de MontréalUniversité Laval
Organismes subventionnairesInstitut TransMedTechNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésOsteoarthritisLasso (programming language)Brier scoreSupport vector machineProportional hazards modelConcordanceMedicineLogistic regressionArtificial intelligenceMachine learningComputer scienceData miningInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: By using machine learning, our study aimed to build a model to predict risk and time to total knee replacement (TKR) of an osteoarthritic knee. METHODS: Features were from the Osteoarthritis Initiative (OAI) cohort at baseline. Using the lasso method for variable selection in the Cox regression model, we identified the 10 most important characteristics among 1,107 features. The prognostic power of the selected features was assessed by the Kaplan-Meier method and applied to 7 machine learning methods: Cox, DeepSurv, random forests algorithm, linear/kernel support vector machine (SVM), and linear/neural multi-task logistic regression models. As some of the 10 first-found features included similar radiographic measurements, we further looked at using the least number of features without compromising the accuracy of the model. Prediction performance was assessed by the concordance index, Brier score, and time-dependent area under the curve (AUC). RESULTS: Ten features were identified and included radiographs, bone marrow lesions of the medial condyle on magnetic resonance imaging, hyaluronic acid injection, performance measure, medical history, and knee-related symptoms. The methodologies Cox, DeepSurv, and linear SVM demonstrated the highest accuracy (concordance index scores of 0.85, Brier score of 0.02, and an AUC of 0.87). DeepSurv was chosen to build the prediction model to estimate the time to TKR for a given knee. Moreover, we were able to decrease the features to only 3 and maintain the high accuracy (concordance index of 0.85, Brier score of 0.02, and AUC of 0.86), which included bone marrow lesions, Kellgren/Lawrence grade, and knee-related symptoms, to predict risk and time of a TKR event. CONCLUSION: For the first time, we developed a model using the OAI cohort to predict with high accuracy if a given osteoarthritic knee would require TKR, when a TKR would be required, and who would likely progress fast toward this event.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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