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Enregistrement W3136502584 · doi:10.1093/femsec/fiab048

Gut microbiome composition predicts summer core range size in two divergent ungulates

2021· article· en· W3136502584 sur OpenAlexafffund
Jesse Wolf, Krystal D. Kriss, Kara M. MacAulay, Keith Munro, Brent R. Patterson, Aaron B. A. Shafer

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensOntario Federation of Anglers and HuntersMinistry of Natural Resources and ForestryMinistry of ForestsTrent University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAssociation Bordelaise pour l'Avancement des Sciences Pediatriques
Mots-clésMicrobiomeGut microbiomeRange (aeronautics)Composition (language)Core (optical fiber)BiologyEcologyBioinformaticsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The gut microbiome of animals vary by age, diet, and habitat, and directly influences an individual's health. Similarly, variation in home ranges is linked to feeding strategies and fitness. Ungulates (hooved mammals) exhibit species-specific microbiomes and habitat use patterns. We combined gut microbiome and movement data to assess relationships between space use and the gut microbiome in a specialist and a generalist ungulate. We GPS radiocollared 24 mountain goats (Oreamnos americanus) and 34 white-tailed deer (Odocoileus virginianus), collected fecal samples, and conducted high-throughput sequencing of the 16S rRNA gene. We generated gut diversity metrics and key bacterial ratios. Our research question centred around the idea that larger Firmicutes to Bacteroidetes ratios confer body size or fat advantages that allow for larger home ranges, and relationships of disproportionate habitat use are stronger in the habitat specialist mountain goat. Firmicutes to Bacteroidetes ratios were positively correlated with core range area in both species. Mountain goats exhibited a negative relationship between gut diversity and proportional use of treed areas and escape terrain, and no relationships were detected in the habitat generalist white-tailed deer. This is the first study to relate range size to the gut microbiome in wild ungulates and is an important proof of concept that advances the information that can be gleaned from non-invasive sampling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,499
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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