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Enregistrement W3136605853 · doi:10.1038/s41467-021-21930-w

Trans-illumination intestine projection imaging of intestinal motility in mice

2021· article· en· W3136605853 sur OpenAlexaff
Depeng Wang, Huijuan Zhang, Tri Vu, Ye Zhan, Akash Malhotra, Pei Wang, Upendra Chitgupi, Aliza Rai, Sizhe Zhang, Lidai Wang, Jan D. Huizinga, Jonathan F. Lovell, Jun Xia

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastrointestinal motility and disorders
Établissements canadiensMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésMotilityLarge intestineProjection (relational algebra)Cell biologyBiologyComputer scienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Functional intestinal imaging holds importance for the diagnosis and evaluation of treatment of gastrointestinal diseases. Currently, preclinical imaging of intestinal motility in animal models is performed either invasively with excised intestines or noninvasively under anesthesia, and cannot reveal intestinal dynamics in the awake condition. Capitalizing on near-infrared optics and a high-absorbing contrast agent, we report the Trans-illumination Intestine Projection (TIP) imaging system for free-moving mice. After a complete system evaluation, we performed in vivo studies, and obtained peristalsis and segmentation motor patterns of free-moving mice. We show the in vivo typical segmentation motor pattern, that was previously shown in ex vivo studies to be controlled by intestinal pacemaker cells. We also show the effects of anesthesia on motor patterns, highlighting the possibility to study the role of the extrinsic nervous system in controlling motor patterns, which requires unanesthetized live animals. Combining with light-field technologies, we further demonstrated 3D imaging of intestine in vivo (3D-TIP). Importantly, the added depth information allows us to extract intestines located away from the abdominal wall, and to quantify intestinal motor patterns along different directions. The TIP system should open up avenues for functional imaging of the GI tract in conscious animals in natural physiological states.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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