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Enregistrement W3136627259 · doi:10.31083/j.fbl2707198

COVIDx-US: An Open-Access Benchmark Dataset of Ultrasound Imaging Data for AI-Driven COVID-19 Analytics

2022· article· en· W3136627259 sur OpenAlexafffund
Ashkan Ebadi, Pengcheng Xi, Alexander MacLean, Adrian Florea, Stéphane Tremblay, Sonny Kohli, Alexander Wong

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Bioscience-Landmark · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUltrasound in Clinical Applications
Établissements canadiensOakville-Trafalgar Memorial HospitalMcGill UniversityNational Research Council CanadaMcMaster UniversityUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational Research Council Canada
Mots-clésTriageBenchmark (surveying)PandemicComputer scienceCoronavirus disease 2019 (COVID-19)AnalyticsGold standard (test)Data sciencePopulationMedical physicsArtificial intelligenceMedicineData miningMachine learningRadiologyMedical emergencyPathologyGeographyCartographyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemic continues to have a devastating effect on the health and well-being of the global population. Apart from the global health crises, the pandemic has also caused significant economic and financial difficulties and socio-physiological implications. Effective screening, triage, treatment planning, and prognostication of outcome play a key role in controlling the pandemic. Recent studies have highlighted the role of point-of-care ultrasound imaging for COVID-19 screening and prognosis, particularly given that it is non-invasive, globally available, and easy-to-sanitize. COVIDx-US Dataset: Motivated by these attributes and the promise of artificial intelligence tools to aid clinicians, we introduce COVIDx-US, an open-access benchmark dataset of COVID-19 related ultrasound imaging data. The COVIDx-US dataset was curated from multiple data sources and its current version, i.e., v1.5., consists of 173 ultrasound videos and 21,570 processed images across 147 patients with COVID-19 infection, non-COVID-19 infection, other lung diseases/conditions, as well as normal control cases. CONCLUSIONS: The COVIDx-US dataset was released as part of a large open-source initiative, the COVID-Net initiative, and will be continuously growing, as more data sources become available. To the best of the authors' knowledge, COVIDx-US is the first and largest open-access fully-curated benchmark lung ultrasound imaging dataset that contains a standardized and unified lung ultrasound score per video file, providing better interpretation while enabling other research avenues such as severity assessment. In addition, the dataset is reproducible, easy-to-use, and easy-to-scale thanks to the well-documented modular design.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,050

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0060,005
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,140
Tête enseignante GPT0,466
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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