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Enregistrement W3137621775 · doi:10.1016/j.jim.2021.113037

Development of a non-biased, high-throughput ELISA for the rapid evaluation of immunogenicity and cross-reactivity

2021· article· en· W3137621775 sur OpenAlexafffund
Jamie E. Fegan, Rong-hua Yu, Epshita A. Islam, Anthony B. Schryvers

Notice bibliographique

RevueJournal of Immunological Methods · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensCanada Research ChairsUniversity of TorontoUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthAlberta Heritage Foundation for Medical Research
Mots-clésImmunogenicityStreptavidinAvidinBiotinBiotinylationPolyclonal antibodiesFusion proteinAntigenEpitopeTransferrinChemistryMolecular biologyBiologyRecombinant DNAMicrobiologyBiochemistryGeneImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Traditional ELISA-based protein analysis has been predicated on the assumption that proteins bind randomly to the solid surface of the ELISA plate polymer (polystyrene or polyvinyl chloride). Random adherence to the plate ensures equal access to all faces of the protein, an important consideration when evaluating immunogenicity of polyclonal serum samples as well as when examining the cross-reactivity of immune serum against different antigenic variants of a protein. In this study we demonstrate that the soluble form of the surface lipoprotein transferrin binding protein B (TbpB) from three different bacterial pathogens (Neisseria meningitidis, Actinobacillus pleuropneumoniae, and Mannheimia haemolytica) bind the ELISA plate in a manner that consistently obscures the transferrin binding face of the proteins' N-lobe. In order to develop a non-biased ELISA where all faces of the protein are accessible, the strong interaction between biotin and avidin has been exploited by adding a biotin tag to these proteins during Escherichia coli-based cytoplasmic expression and utilizing streptavidin or neutravidin coated ELISA plates for protein capture and display. The use of avidin coated ELISA plates also allows for rapid purification of biotin-tagged proteins from crude E. coli lysates, removing the requirement of prior affinity purification of each protein to be included in the ELISA-based analyses. In proof of concept experiments we demonstrate the utility of this approach for evaluating immunogenicity and cross-reactivity of serum from mice and pigs immunized with TbpBs from human and porcine pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,295
Score d'incertitude au seuil0,477

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,104
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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