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Enregistrement W3137688196 · doi:10.1016/j.isci.2021.102351

Immune activation during Paenibacillus brain infection in African infants with frequent cytomegalovirus co-infection

2021· article· en· W3137688196 sur OpenAlexaff
Albert M. Isaacs, Sarah U. Morton, Mercedeh Movassagh, Qiang Zhang, Christine Hehnly, Lijun Zhang, Diego M. Morales, Shamim A. Sinnar, Jessica E. Ericson, Edith Mbabazi-Kabachelor, Peter Ssenyonga, Justin Onen, Ronnie Mulondo, Mady Hornig, Benjamin C. Warf, James R. Broach, R. Reid Townsend, David D. Limbrick, Joseph N. Paulson, Steven J. Schiff

Notice bibliographique

RevueiScience · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesInstitute of Clinical and Translational SciencesPennsylvania State UniversityMedtronic
Mots-clésNeuroinflammationImmunologyImmune systemAcquired immune systemInnate immune systemBiologyInflammationNeonatal sepsisSepsisMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inflammation during neonatal brain infections leads to significant secondary sequelae such as hydrocephalus, which often follows neonatal sepsis in the developing world. In 100 African hydrocephalic infants we identified the biological pathways that account for this response. The dominant bacterial pathogen was a Paenibacillus species, with frequent cytomegalovirus co-infection. A proteogenomic strategy was employed to confirm host immune response to Paenibacillus and to define the interplay within the host immune response network. Immune activation emphasized neuroinflammation, oxidative stress reaction, and extracellular matrix organization. The innate immune system response included neutrophil activity, signaling via IL-4, IL-12, IL-13, interferon, and Jak/STAT pathways. Platelet-activating factors and factors involved with microbe recognition such as Class I MHC antigen-presenting complex were also increased. Evidence suggests that dysregulated neuroinflammation propagates inflammatory hydrocephalus, and these pathways are potential targets for adjunctive treatments to reduce the hazards of neuroinflammation and risk of hydrocephalus following neonatal sepsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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