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Enregistrement W3137777844 · doi:10.1007/s00259-021-05303-5

[18F]FDG PET radiomics to predict disease-free survival in cervical cancer: a multi-scanner/center study with external validation

2021· article· en· W3137777844 sur OpenAlexaff
Marta S. Ferreira, Pierre Lovinfosse, Johanne Hermesse, Marjolein Decuypere, Caroline Rousseau, François Lucia, Ulrike Schick, Caroline Reinhold, Philippe Robin, Mathieu Hatt, Dimitris Visvikis, Claire Bernard, Ralph T. H. Leijenaar, Frédéric Kridelka, Philippe Lambin, Patrick Meyer, Roland Hustinx

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesHorizon 2020European Commission
Mots-clésMedicineRadiomicsCervical cancerNuclear medicinePET-CTRadiologyCancerPositron emission tomographyCenter (category theory)Medical physicsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose To test the performances of native and tumour to liver ratio (TLR) radiomic features extracted from pre-treatment 2-[18F] fluoro-2-deoxy-D-glucose ([18F]FDG) PET/CT and combined with machine learning (ML) for predicting cancer recurrence in patients with locally advanced cervical cancer (LACC). Methods One hundred fifty-eight patients with LACC from multiple centers were retrospectively included in the study. Tumours were segmented using the Fuzzy Local Adaptive Bayesian (FLAB) algorithm. Radiomic features were extracted from the tumours and from regions drawn over the normal liver. Cox proportional hazard model was used to test statistical significance of clinical and radiomic features. Fivefold cross validation was used to tune the number of features. Seven different feature selection methods and four classifiers were tested. The models with the selected features were trained using bootstrapping and tested in data from each scanner independently. Reproducibility of radiomics features, clinical data added value and effect of ComBat-based harmonisation were evaluated across scanners. Results After a median follow-up of 23 months, 29% of the patients recurred. No individual radiomic or clinical features were significantly associated with cancer recurrence. The best model was obtained using 10 TLR features combined with clinical information. The area under the curve (AUC), F1-score, precision and recall were respectively 0.78 (0.67–0.88), 0.49 (0.25–0.67), 0.42 (0.25–0.60) and 0.63 (0.20–0.80). ComBat did not improve the predictive performance of the best models. Both the TLR and the native models performance varied across scanners used in the test set. Conclusion [18F]FDG PET radiomic features combined with ML add relevant information to the standard clinical parameters in terms of LACC patient’s outcome but remain subject to variability across PET/CT devices.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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