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Enregistrement W3137843134 · doi:10.1101/2021.03.20.21254005

Alternative splicing of <i>OAS1</i> alters the risk for severe COVID-19

2021· preprint· en· W3137843134 sur OpenAlexafffund
Jennifer E. Huffman, Guillaume Butler‐Laporte, Atlas Khan, Theodore G. Drivas, Gina M. Peloso, Tomoko Nakanishi, Anurag Verma, Krzysztof Kiryluk, J. Brent Richards, Hugo Zeberg

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYersinia bacterium, plague, ectoparasites research
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilPerelman School of Medicine, University of PennsylvaniaNational Institutes of HealthPublic Health AgencyEuropean CommissionJeanssons StiftelserKing's College LondonFonds de Recherche du Québec - SantéUniversity of Pennsylvania Health SystemUniversity of PennsylvaniaGeorgia Clinical and Translational Science AllianceCanadian Institutes of Health ResearchCompute CanadaJapan Society for the Promotion of ScienceCancer Research UKPublic Health Agency of CanadaMcGill UniversityJewish General HospitalNational Institute for Health and Care ResearchRegeneron Pharmaceuticals
Mots-clésLocus (genetics)HaplotypeGeneticsBiologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)NeanderthalAlleleGeneGeographyMedicineDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT A locus containing OAS1/2/3 has been identified as a risk locus for severe COVID-19 among Europeans ancestry individuals, with a protective haplotype of ∼75 kilobases derived from Neanderthals. Here, we show that among several potentially causal variants at this locus, a splice variant of OAS1 occurs in people of African ancestry independently of the Neanderthal haplotype and confers protection against COVID-19 of a magnitude similar to that seen in individuals without African ancestry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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