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Enregistrement W3137845904 · doi:10.1093/cid/ciab268

MSG07: An International Cohort Study Comparing Epidemiology and Outcomes of Patients With <i>Cryptococcus neoformans</i> or <i>Cryptococcus gattii</i> Infections

2021· article· en· W3137845904 sur OpenAlexaff
John W. Baddley, Sharon C.‐A. Chen, Carrie Huisingh, Kaitlin Benedict, Emilio DeBess, Eleni Galanis, Brendan R. Jackson, Laura MacDougall, Nicola Marsden-Haug, Hanna N. Oltean, John R. Perfect, Peter Phillips, Tania C. Sorrell, Peter G. Pappas

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalBC Centre for Disease ControlUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésCryptococcosisCryptococcus gattiiCryptococcus neoformansMedicineOdds ratioInternal medicineEpidemiologyRetrospective cohort studyCryptococcusAmphotericin BCohortImmunologyBiologyMicrobiologyAntifungalDermatology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cryptococcosis due to Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii varies with geographic region, populations affected, disease manifestations, and severity of infection, which impact treatment. METHODS: We developed a retrospective cohort of patients diagnosed with culture-proven cryptococcosis during 1995-2013 from 5 centers in North America and Australia. We compared underlying diseases, clinical manifestations, treatment, and outcomes in patients with C. gattii or C. neoformans infection. RESULTS: A total of 709 patients (452 C. neoformans; 257 C. gattii) were identified. Mean age was 50.2 years; 61.4% were male; and 52.3% were white. Time to diagnosis was prolonged in C. gattii patients compared with C. neoformans (mean, 52.2 vs 36.0 days; P < .003), and there was a higher proportion of C. gattii patients without underlying disease (40.5% vs 10.2%; P < .0001). Overall, 59% had central nervous system (CNS) infection, with lung (42.5%) and blood (24.5%) being common sites. Pulmonary infection was more common in patients with C. gattii than in those with C. neoformans (60.7% vs 32.1%; P < .0001). CNS or blood infections were more common in C. neoformans-infected patients (P ≤ .0001 for both). Treatment of CNS disease with induction therapy of amphotericin B and flucytosine occurred in 76.4% of patients. Crude 12-month mortality was higher in patients with C. neoformans (28.4% vs 20.2%; odds ratio, 1.56 [95% confidence interval, 1.08-2.26]). CONCLUSIONS: This study emphasizes differences in species-specific epidemiology and outcomes of patients with cryptococcosis, including underlying diseases, site of infection, and mortality. Species identification in patients with cryptococcosis is necessary to discern epidemiologic patterns, guide treatment regimens, and predict clinical progression and outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,837

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,396
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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