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Enregistrement W3138022576 · doi:10.1159/000514667

Amylase Alpha 1 Gene (<b><i>AMY1</i></b>) Copy Number Variation and Dental Caries Experience: A Pilot Study among Adults in Lithuania

2021· article· en· W3138022576 sur OpenAlexaff
Lina Stangvaltaite‐Mouhat, Алина Пуриене, Jolanta Aleksejūnienė, Indrė Stankevičienė, Berit Tømmerås, Mohammed Al‐Haroni

Notice bibliographique

RevueCaries Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalivaMedicineAnimal scienceDemographyBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Genetic biomarkers have the potential to be used in personalised dentistry for improved prevention and decision-making in caries management. The amylase alpha 1 gene (AMY1) encodes salivary α-amylase and may be one such biomarker. We examined the association between AMY1 copy number variation (CNV) and dental caries experience in adults. MATERIALS AND METHODS: A stratified random sample of 193 participants from the Lithuanian National Oral Health Survey (LNOHS) agreed to provide saliva samples and were included in this analysis (age 35-44 years; participation rate 43%). Information on socio-demographic and behavioural characteristics was taken from the LNHOS, which used the self-administered World Health Organisation (WHO) questionnaire. Data on fluoride levels in drinking water at the recruitment areas was recorded based on information provided by water suppliers. Dental caries experience was recorded at a surface level (smooth-surface and occlusal-surface decayed, missing, filled surfaces [D3MFS] score) by one trained and calibrated examiner using WHO criteria, and subsequently dichotomised for the statistical analyses. DNA extracted from saliva samples was used to investigate AMY1 CNV using the QX200 droplet digital PCR system. Bivariate and multivariable statistical analyses were employed. RESULTS: When compared to participants with an AMY1 copy number (CN) of 2-3, higher odds of smooth-surface D3MFS >14 was observed for participants with a CN of 4-5 (OR 13.3, 95% CI 2.1-86.3), 6-9 (OR 7.0, 95% CI 1.4-34.1), and 10-16 (OR 5.8, 95% CI 1.2-32.2). Female sex was independently associated with a smooth-surface D3MFS >14 (OR 5.7, 95% CI 1.9-17.2). CONCLUSIONS: Our study demonstrated an association between AMY1 CNV and high smooth-surface caries experience. Studies with larger sample sizes are needed to validate this association.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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