microRNA-mediated translation repression through GYF-1 and IFE-4 in <i>C. elegans</i> development
Notice bibliographique
Résumé
microRNA (miRNA)-mediated gene silencing is enacted through the recruitment of effector proteins that direct translational repression or degradation of mRNA targets, but the relative importance of their activities for animal development remains unknown. Our concerted proteomic surveys identified the uncharacterized GYF-domain encoding protein GYF-1 and its direct interaction with IFE-4, the ortholog of the mammalian translation repressor 4EHP, as key miRNA effector proteins in Caenorhabditis elegans. Recruitment of GYF-1 protein to mRNA reporters in vitro or in vivo leads to potent translation repression without affecting the poly(A) tail or impinging on mRNA stability. Loss of gyf-1 is synthetic lethal with hypomorphic alleles of embryonic miR-35-42 and larval (L4) let-7 miRNAs, which is phenocopied through engineered mutations in gyf-1 that abolish interaction with IFE-4. GYF-1/4EHP function is cascade-specific, as loss of gyf-1 had no noticeable impact on the functions of other miRNAs, including lin-4 and lsy-6. Overall, our findings reveal the first direct effector of miRNA-mediated translational repression in C. elegans and its physiological importance for the function of several, but likely not all miRNAs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».