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Enregistrement W3138569498 · doi:10.1002/mds.28517

Genotype–Phenotype Relations for the Atypical Parkinsonism Genes: MDSGene Systematic Review

2021· review· en· W3138569498 sur OpenAlexafffund
Christina Wittke, Sonja Petkovic, Valerija Dobričić, Susen Schaake, Gesine Respondek, Anne Weißbach, Harutyun Madoev, Joanne Trinh, Eva‐Juliane Vollstedt, Neele Kuhnke, Katja Lohmann, Marija Dulovic Mahlow, Connie Marras, Inke R. König, María Stamelou, Vincenzo Bonifati, Christina M. Lill, Meike Kasten, Hans‐Jürgen Huppertz, Günter U. Höglinger, Christine Klein

Notice bibliographique

RevueMovement Disorders · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensToronto Western HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeCanadian Institutes of Health ResearchDeutsche KrebshilfeNational Institute on AgingDeutsche ForschungsgemeinschaftNOMIS StiftungBundesministerium für Bildung und ForschungAlzheimer NederlandZonMwInternational Parkinson and Movement Disorder SocietyMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésParkinsonismProgressive supranuclear palsyCorticobasal degenerationLevodopaMedicineAge of onsetMovement disordersPediatricsPsychologyAtrophyPathologyParkinson's diseaseDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT This Movement Disorder Society Genetic mutation database Systematic Review focuses on monogenic atypical parkinsonism with mutations in the ATP13A2 , DCTN1 , DNAJC6 , FBXO7 , SYNJ1 , and VPS13C genes. We screened 673 citations and extracted genotypic and phenotypic data for 140 patients (73 families) from 77 publications. In an exploratory fashion, we applied an automated classification procedure via an ensemble of bootstrap‐aggregated (“bagged”) decision trees to distinguish these 6 forms of monogenic atypical parkinsonism and found a high accuracy of 86.5% (95%CI, 86.3%–86.7%) based on the following 10 clinical variables: age at onset, spasticity and pyramidal signs, hypoventilation, decreased body weight, minimyoclonus, vertical gaze palsy, autonomic symptoms, other nonmotor symptoms, levodopa response quantification, and cognitive decline. Comparing monogenic atypical with monogenic typical parkinsonism using 2063 data sets from Movement Disorder Society Genetic mutation database on patients with SNCA , LRRK2 , VPS35 , Parkin , PINK1 , and DJ‐1 mutations, the age at onset was earlier in monogenic atypical parkinsonism (24 vs 40 years; P = 1.2647 × 10 −12 ) and levodopa response less favorable than in patients with monogenic typical presentations (49% vs 93%). In addition, we compared monogenic to nonmonogenic atypical parkinsonism using data from 362 patients with progressive supranuclear gaze palsy, corticobasal degeneration, multiple system atrophy, or frontotemporal lobar degeneration. Although these conditions share many clinical features with the monogenic atypical forms, they can typically be distinguished based on their later median age at onset (64 years; IQR, 57–70 years). In conclusion, age at onset, presence of specific signs, and degree of levodopa response inform differential diagnostic considerations and genetic testing indications in atypical forms of parkinsonism. © 2021 The Authors. Movement Disorders published by Wiley Periodicals LLC on behalf of International Parkinson Movement Disorder Society.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,738
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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