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Enregistrement W3138681098 · doi:10.1101/2021.03.19.21253429

SARS-CoV-2 Seroprevalence in 12 Cities of India from July-December 2020

2021· preprint· en· W3138681098 sur OpenAlexafffund
Arokiaswamy Velumani, Chaitali Nikam, Wilson Suraweera, Sze Hang Fu, Hellen Gelband, Patrick Brown, Isaac I. Bogoch, Nico Nagelkerke, Prabhat Jha

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensCentre for Global Health ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Toronto
Mots-clésSeroprevalenceDemographyMedicineCase fatality rateMeaslesEpidemiologyPopulationVaccinationCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Transmission (telecommunications)Mortality rateGeographyEnvironmental healthSerologyImmunologyDiseaseAntibodyInfectious disease (medical specialty)Internal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Objectives We sought to understand the spread of SARS-CoV-2 infection in urban India, which has surprisingly low COVID-19 deaths. Design Cross-sectional and trend analyses of seroprevalence in self-referred test populations, and of reported cases and COVID mortality data. Participants 448,518 self-referred individuals using a nationwide chain of private laboratories with central testing of SARS-CoV-2 antibodies and publicly available case and mortality data. Setting 12 populous cities with nearly 92 million total population. Main outcome measures Seropositivity trends and predictors (using a Bayesian geospatial model) and prevalence derived from mortality data and infection fatality rates (IFR). Results For the whole of India, 31% of the self-referred individuals undergoing antibody testing were seropositive for SARS-CoV-2 antibodies. Seropositivity was higher in females (35%) than in males (30%) overall and in nearly every age group. In these 12 cities, seroprevalence rose from about 18% in July to 41% by December, with steeper increases at ages <20 and 20-44 years than at older ages. The “M-shaped” age pattern is consistent with intergenerational transmission. Areas of higher childhood measles vaccination in earlier years had lower seropositivity. The patterns of increase in seropositivity and in peak cases and deaths varied substantially across cities. In Delhi, death rates and cases first peaked in June and again in November; Chennai had a single peak in July. Based local IFRs and COVID deaths (adjusted for undercounts), we estimate that 43%-65% of adults above age 20 had been infected (range of mid-estimates of 12%-77%) corresponding 26 to 36 million infected adults in these cities, or an average of 9-12 infected adults per confirmed case. Conclusion Even with relatively low death rates, the large cities of India had remarkably high levels of SARS-CoV-2 infection. Vaccination strategies need to consider widespread intergenerational transmission.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,418
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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