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Enregistrement W3138889605 · doi:10.1038/s41398-021-01282-1

The association between family history and genomic burden with schizophrenia mortality: a Swedish population-based register and genetic sample study

2021· article· en· W3138889605 sur OpenAlexafffund
Kaarina Kowalec, Yi Lu, Jie Song, Christina Dalman, Christina M. Hultman, Henrik Larsson, Paul Lichtenstein, Patrick F. Sullivan

Notice bibliographique

RevueTranslational Psychiatry · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthHorizon 2020 Framework ProgrammeKarolinska InstitutetEuropean CommissionVetenskapsrådetGovernment of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchStockholms Läns LandstingUniversity of Manitoba
Mots-clésPopulationHeritabilityMedicineSchizophrenia (object-oriented programming)DemographyGenetic associationGenome-wide association studyProportional hazards modelEpidemiologyGeneticsBiologyPsychiatrySingle-nucleotide polymorphismInternal medicineEnvironmental healthGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Individuals with schizophrenia (SCZ) have a 2-3-fold higher risk of mortality than the general population. Heritability of mortality in psychiatric disorders has been proposed; however, few have investigated SCZ family history and genetic variation, with all-cause and specific causes of death. We aimed to identify correlates of SCZ mortality using genetic epidemiological and genetic modelling in two samples: a Swedish national population sample and a genotyped subsample. In the Swedish national population sample followed from the first SCZ treatment contact until emigration, death or end of the follow-up, we investigated a standardised measure of SCZ family history. In a subgroup with comprehensive genetic data, we investigated the impact of common and rare genetic variation. Cox proportional hazards regression was used to estimate the association between various factors and mortality (all and specific causes). A total of 13727 SCZ cases fulfilled criteria for the population-based analyses (1268 deaths, 9.2%). The genomic subset contained 4991 cases (1353 deaths, 27.1%). Somatic mutations associated with clonal hematopoiesis with unknown drivers were associated with all-cause mortality (HR 1.77, 95% CI: 1.26-2.49). No other heritable measures were associated with all-cause mortality nor with any specific causes of death. Future studies in larger, comparable cohorts are warranted to further understand the association between hereditary measures and mortality in SCZ.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,479

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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