High prevalence of genotypes associated with sulfadoxine/pyrimethamine resistance in the rural area of Fougamou, Gabon
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Pregnancy-associated malaria (PAM) is a complex form of malaria. To prevent PAM, several African countries have adopted intermittent preventive treatment with sulfadoxine/pyrimethamine (IPT-SP). However, resistance to SP has been reported, associated with mutations in the genes Plasmodium falciparum dihydropteroate synthase (Pfdhps) and P. falciparum dihydrofolate reductase (Pfdhfr). The aim of this study was to investigate the prevalence of mutations in Pfdhfr and Pfdhps in P. falciparum isolates from rural areas of Gabon. METHODS: A cross-sectional survey of febrile patients (n = 202) who consulted Fougamou Health Center between February-May 2016 was performed. DNA was extracted from patient samples and the Pfdhfr and Pfdhps genes were genotyped using PCR-RFLP. Statistical analyses were performed. RESULTS: The malaria prevalence in febrile patients included in the study was 60.4% (122/202). The main parasite species was P. falciparum (96.7%; 118/122), followed by Plasmodium malariae (3.3%; 4/122). Genotypes on codons 16, 51, 59 and 108 of Pfdhfr were highly mutated (>96%). In Pfdhps, codons 436, 437, 540 and 613 also expressed high mutation rates. The prevalence of triple mutations of Pfdhfr VIRNI and AIRNI was 12.1% and 84.5%, respectively. The prevalence of mutant haplotypes of Pfdhps SGEA, SGKA and AGEA was 37.9%, 25.9% and 12.1%, respectively. The prevalence of quadruple mutants IRN-A and IRN-G was 20.0% and 93.1%, respectively, whereas quintuple mutants were found at 57.8% (IRN-GE) and 5.0% (IRN-AE). CONCLUSION: Our data show a high prevalence of genotypes associated with SP resistance. Clinical trials to investigate the efficacy of IPT-SP are much needed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».