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Enregistrement W3139074072 · doi:10.1101/2021.03.18.436095

Does the Zebra Finch Mating Song Circuit Use Spike Times Efficiently?

2021· preprint· en· W3139074072 sur OpenAlexaff
Wilten Nicola, Thomas Robert Newton, Claudia Clopath

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Vocal Communication and Behavior
Établissements canadiensHotchkiss Brain InstituteUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebra finchComputer scienceSpike (software development)ENCODEBiological neural networkEncoding (memory)Neural codingCoding (social sciences)Spike sortingArtificial intelligenceNeuroscienceBiologyMathematicsMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Precise and reliable spike times are thought to subserve multiple possible functions, including improving the accuracy of encoding stimuli or behaviours relative to other coding schemes. Indeed, repeating sequences of spikes with sub-millisecond precision exist in nature, such as the synfire chain of spikes in area HVC of the zebra-finch mating-song circuit. Here, we analyzed what impact precise and reliable spikes have on the encoding accuracy for both the zebra-finch and more generic neural circuits using computational modelling. Our results show that neural circuits can use precisely timed spikes to encode signals with a higher-order accuracy than a conventional rate code. Circuits with precisely timed and reliably emitted spikes increase their encoding accuracy linearly with network size, which is the hallmark signature of an efficient code. This qualitatively differs from circuits that employ a rate code which increase their encoding accuracy with the square-root of network size. However, this improved scaling is dependent on the spikes becoming more accurate and more reliable with larger networks. Finally, we discuss how to test this scaling relationship in the zebra mating song circuit using both neural data and song-spectrogram-based recordings while taking advantage of the natural fluctuation in HVC network size due to neurogenesis. The zebra-finch mating-song circuit may represent the most likely candidate system for the use of spike-timing-based, efficient coding strategies in nature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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