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Enregistrement W3139158277 · doi:10.3389/fimmu.2021.636225

Case Report: Novel SAVI-Causing Variants in STING1 Expand the Clinical Disease Spectrum and Suggest a Refined Model of STING Activation

2021· article· en· W3139158277 sur OpenAlexaff
Bin Lin, Sofia Torreggiani, Dana Kahle, Dax G. Rumsey, Benjamin L. Wright, Marco Antonio Montes‐Cano, Laura Fernández Silveira, Sara Alehashemi, Jacob T. Mitchell, Alexander G. Aue, Zheng Ji, Tengchuan Jin, Adriana A. de Jesus, Raphaela Goldbach‐Mansky

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésStingStimulator of interferon genesPhenotypeMutationDiseaseMedicineBiologyGeneticsGeneReceptorInternal medicineInnate immune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gain-of-function mutations in STING1 cause the monogenic interferonopathy, SAVI, which presents with early-onset systemic inflammation, cold-induced vasculopathy and/or interstitial lung disease. We identified 5 patients (3 kindreds) with predominantly peripheral vascular disease who harbor 3 novel STING1 variants, p.H72N, p.F153V, and p.G158A. The latter two were predicted by a previous cryo-EM structure model to cause STING autoactivation. The p.H72N variant in exon 3, however, is the first SAVI-causing variant in the transmembrane linker region. Mutations of p.H72 into either charged residues or hydrophobic residues all led to dramatic loss of cGAMP response, while amino acid changes to residues with polar side chains were able to maintain the wild type status. Structural modeling of these novel mutations suggests a reconciled model of STING activation, which indicates that STING dimers can oligomerize in both open and closed states which would obliviate a high-energy 180° rotation of the ligand-binding head for STING activation, thus refining existing models of STING activation. Quantitative comparison showed that an overall lower autoactivating potential of the disease-causing mutations was associated with less severe lung disease, more severe peripheral vascular disease and the absence of a robust interferon signature in whole blood. Our findings are important in understanding genotype-phenotype correlation, designing targeted STING inhibitors and in dissecting differentially activated pathways downstream of different STING mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0050,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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