Assessment of the possible inhibitory effect of carrageenan in human papillomavirus DNA testing by polymerase chain reaction amplification
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
We assessed carrageenan's potential to inhibit human papillomavirus (HPV) DNA extraction and amplification in vaginal swab samples collected in a trial, assessing the efficacy of a carrageenan-based gel against HPV infections. Experiment #1 consisted of adding gel (carrageenan-containing or placebo) to swabs and comparing HPV DNA detection by polymerase chain reaction (PCR) to unmanipulated samples collected from the same participants. For Experiments #2 and #3, we tested vaginal samples for inhibition by addition of an internal control and amplification by real-time PCR. Experiment #4 investigated carrageenan's interference with the extraction process by assessing HPV45 detectability in undiluted and diluted HPV45 positive samples (n = 3) with carrageenan versus no gel. In Experiment #1, there was a loss of HPV positivity with the addition of carrageenan (n = 9), but none with placebo gel (n = 5). In Experiments #2 and #3, the absence of the amplified product was observed in samples from the carrageenan arm: 3.3% (1/30) and 0.5% (1/199) of samples. In Experiment #4, HPV45 was not detected in undiluted carrageenan-containing samples, but after 1/50 dilution, the same HPV45 copy number was detected. Carrageenan does not affect the DNA extraction process, and inhibition of HPV DNA amplification by carrageenan occurs infrequently.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle