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Enregistrement W3139360595 · doi:10.1136/jitc-2020-001965

High-dimensional analysis of the adenosine pathway in high-grade serous ovarian cancer

2021· review· en· W3139360595 sur OpenAlexafffund
Yacine Barèche, Sandra Pommey, Mayra Carneiro, Laurence Buisseret, Isabelle Cousineau, Paméla Thébault, Pavel Chrobák, Laudine Communal, David Allard, Simon C. Robson, Anne‐Marie Mes‐Masson, Diane Provencher, Réjean Lapointe, John Stagg

Notice bibliographique

RevueJournal for ImmunoTherapy of Cancer · 2021
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchInstitute of Cancer ResearchNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthUniversité de MontréalTerry Fox Research Institute
Mots-clésImmune systemOvarian cancerCancer researchGene signatureTranscriptomeTumor microenvironmentCancerCD8BiologyMedicineMicroarrayMicroarray analysis techniquesImmunologyGene expressionInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Hydrolysis of extracellular ATP to adenosine (eADO) is an important immune checkpoint in cancer immunology. We here investigated the impact of the eADO pathway in high-grade serous ovarian cancer (HGSC) using multiparametric platforms. METHODS: We performed a transcriptomic meta-analysis of eADO-producing CD39 and CD73, an eADO signaling gene signature, immune gene signatures and clinical outcomes in approximately 1200 patients with HGSC. Protein expression, localization and prognostic impact of CD39, CD73 and CD8 were then performed on approximately 1000 cases on tissue microarray, and tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) were analyzed by flow cytometry and single-cell RNA sequencing on a subset of patients. RESULTS: Concomitant CD39 and CD73 gene expression, as well as high levels of an eADO gene signature, were associated with worse prognosis in patients with HGSC, notably in the immunoregulatory molecular subtype, characterized by an immune-active microenvironment. CD39 was further associated with primary chemorefractory and chemoresistant human HGSC and platinum-based chemotherapy of murine HGSC was significantly more effective in CD39-deficient mice. At protein level, CD39 and CD73 were predominantly expressed by cancer-associated fibroblasts, and CD39 was expressed on severely exhausted, clonally expanded and putative tissue-resident memory TILs. CONCLUSIONS: Our study revealed the clinical, immunological, subtype-specific impacts of eADO signaling in HGSC, unveiled the chemoprotective effect of CD39 and supports the evaluation of eADO-targeting agents in patients with ovarian cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,968
Score d'incertitude au seuil0,914

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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