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Enregistrement W3139384303 · doi:10.25011/cim.v44i1.36016

A Novel Composite Biomarker Panel For Detection Of Early Stage Non-small Cell Lung Cancer

2021· article· en· W3139384303 sur OpenAlexafffundvenue
Eric L.R. Bédard, Aswin Abraham, Anil A. Joy, Sunita Ghosh, Xiaoyu Wang, A. J. Lim, Dongyu Shao, Raimar Löebenberg, Wilson Roa

Notice bibliographique

RevueClinical and investigative medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of AlbertaAlberta Health Services
Organismes subventionnairesUniversity of Alberta
Mots-clésLung cancerBiomarkerMedicineStage (stratigraphy)OncologyInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To investigate a novel composite methodology of using targeted serum microRNAs (micro ribonucleic acid; miRNA) and urine metabolites for the accurate detection of early stage non-small cell lung cancer (NSCLC). METHODS: Consecutively consenting NSCLC patients and matched control subjects were recruited to provide samples of serum for miRNA and/or urine for metabolite analyses. Serum miRNA levels were measured using quantitative real-time reverse-transcription with exogenous control, and the comparative delta cycle threshold (CT) method was used to calculate relative miRNA expression of two targeted miRNAs (miR-21 and miR-223). The concentrations of six targeted urinary metabolites in patients and healthy controls were measured using proton nuclear magnetic resonance (1H NMR) spectroscopy. A composite methodology of using the 35 accruals with both serum and urine biomarkers was then established with binary logistic regression, receiver operating characteristic (ROC) models with or without artificial intelligence (AI). RESULTS: The ROC analysis of miRNA expression yielded a sensitivity of 96.4% and a specificity of 88.2% for the detection of early stage NSCLC, with area under the curve (AUC) = 0.91 (CI 95%: 0.80-1.0). Relative urinary concentrations of 4-methoxyphenylacetic acid (4MPLA) were significantly different between NSCLC and healthy control (p=0.008). The ROC analysis of 4MPLA yielded a sensitivity of 82.1% and a specificity of 88.2%, with AUC = 0.85. The composite process combining miRNA and metabolite expression demonstrated a sensitivity and specificity of nearly 100% and AUC=1. CONCLUSIONS: A highly specific, sensitive and non-invasive detection method for NSCLC was developed. Pending validation, this can potentially improve the early detection and, hence, the treatment and survival outcomes of patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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