Species limits, patterns of secondary contact and a new species in the <i>Trogon rufus</i> complex (Aves: Trogonidae)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The black-throated trogon, Trogon rufus, is a widespread, polytypic species-complex with a convoluted taxonomic history. Here, we integrated morphological, vocal and genetic datasets, including spectral data and digital quantification of barred plumage, to assess and redefine its species limits according to the foremost species concepts. We suggest the recognition of four named and one new species. Trogon tenellus and T. cupreicauda are divergent across Central and South America without geographic overlap or intermediates. Trogon chrysochloros in the Atlantic Forests of Brazil is phenotypically, genetically and ecologically distinct. In Amazonia, Trogon rufus consists of three phenotypically distinct subspecies intergrading with each other in a ring-like formation around central Amazonian rivers. Trogon rufus rufus in the Guiana Shield, Trogon rufus amazonicus in south-eastern Amazonia and Trogon rufus sulphureus in western Amazonia, with contact across the Lower Amazon and Madeira rivers, likely due to secondary contact between incompletely diverged lineages. The unique combination of song, morphology and mtDNA features of an unnamed, isolated population in the Atlantic Forest of north-eastern Brazil resulted in its description as a new species, known only from the type locality and considered here as Critically Endangered, requiring urgent conservation actions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».