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Enregistrement W3139524553 · doi:10.1111/jvim.16060

Investigation of spatio-temporal clusters of positive leptospirosis polymerase chain reaction test results in dogs in the United States, 2009 to 2016

2021· article· en· W3139524553 sur OpenAlexaff
Amanda M. Smith, Jason W. Stull, Michelle Evason, J. Scott Weese, Thomas E. Wittum, Donald Szlosek, Andréia G. Arruda

Notice bibliographique

RevueJournal of Veterinary Internal Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueLeptospirosis research and findings
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLeptospirosisScan statisticMedicineLeptospiraVeterinary medicinePopulationDemographyEnvironmental healthStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Leptospirosis is a zoonotic disease of concern and an investigation of recent spatio-temporal trends of leptospirosis in dogs in the United States is needed. Leptospira PCR testing has become increasingly used in veterinary clinical medicine and these data might provide information on recent trends of disease occurrence. OBJECTIVES: To identify and describe clusters of PCR-positive Leptospira test results in dogs in the United States. ANIMALS: Leptospira real-time PCR test results from dogs (n = 40 118) in the United States from IDEXX Laboratories, Inc., between 2009 and 2016 were included in the analysis. METHODS: In this retrospective study, spatio-temporal clusters for a real-time PCR-positive test were identified using the space-time permutation scan statistic and the centroid of the zip code reported for each test. A maximum spatial window of 20% of the population at risk, and a maximum temporal window of 6 months were used. RESULTS: Seven statistically significant space-time clusters of Leptospira real-time PCR-positive test results were identified across the United States: 1 each located within the states of Arizona (2016), California (2014-2015), Florida (2010), South Carolina (2015), and 1 each located within the south-central region (2015), midwest region (2014), and northeast region (2011). Clusters ranged from 3 to 108 dogs and were identified during all years under study, except 2009, 2012, and 2013. CONCLUSIONS AND CLINICAL IMPORTANCE: The spatial and temporal components of leptospirosis in dogs in this study are similar to those in previous work. However, clusters were identified in new areas, demonstrating the complex epidemiology of this disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,622
Score d'incertitude au seuil0,611

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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