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Enregistrement W3140047415 · doi:10.3390/microorganisms9040742

Global Landscape Review of Serotype-Specific Invasive Pneumococcal Disease Surveillance among Countries Using PCV10/13: The Pneumococcal Serotype Replacement and Distribution Estimation (PSERENADE) Project

2021· article· en· W3140047415 sur OpenAlexaff
Maria Deloria Knoll, Julia C. Bennett, Maria Garcia Quesada, E. Wangeci Kagucia, Meagan E. Peterson, Daniel R. Feikin, Adam L. Cohen, Marissa K. Hetrich, Yangyupei Yang, Jenna N. Sinkevitch, Krow Ampofo, Laurie Aukes, Sabrina Bacci, Godfrey Bigogo, Maria-Cristina de C. Brandileone, Michael G. Bruce, Romina Camilli, Jesús Castilla, Guanhao Chan, Grettel Chanto Chacón, Pilar Ciruela, Heather Cook, Mary Corcoran, Ron Dagan, Kostas Danis, Sara de Miguel, Philippe De Wals, Stefanie Desmet, Yvonne Galloway, Theano Georgakopoulou, Laura L. Hammitt, Markus Hilty, Pak‐Leung Ho, Sanjay Jayasinghe, James D. Kellner, Jackie Kleynhans, Mirjam J. Knol, Jana Kozáková, Karl G. Kristinsson, Shamez Ladhani, María Eugenia León, Tiia Lepp, Grant Mackenzie, Lucia Maďarová, Allison McGeer, Tuya Mungun, Jason M. Mwenda, J. Pekka Nuorti, Néhémie Nzoyikorera, Kazunori Oishi, Lúcia de Oliveira, Metka Paragi, Tamara Pilishvili, Rodrigo Puentes, Eric Rafai, Samir K. Saha, Larisa Savrasova, Camelia Savulescu, J. Anthony G. Scott, Kevin J Scott, Fatima Serhan, Lena Setchanova, Nadja Sinkovec Zorko, Anna Skoczyńska, Todd D. Swarthout, Palle Valentiner‐Branth, Mark van der Linden, Didrik F. Vestrheim, Anne von Gottberg, İnci Yıldırım, Kyla Hayford

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of CalgaryUniversity Health NetworkAlberta Health ServicesUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesPan American Health OrganizationEuropean Centre for Disease Prevention and ControlBill and Melinda Gates FoundationJohns Hopkins UniversityWorld Health Organization
Mots-clésPneumococcal diseaseSerotypeEstimationScheduleMedicineDisease surveillanceEnvironmental healthGeographyDiseaseBiologyStreptococcus pneumoniaeVirologyComputer scienceInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Serotype-specific surveillance for invasive pneumococcal disease (IPD) is essential for assessing the impact of 10- and 13-valent pneumococcal conjugate vaccines (PCV10/13). The Pneumococcal Serotype Replacement and Distribution Estimation (PSERENADE) project aimed to evaluate the global evidence to estimate the impact of PCV10/13 by age, product, schedule, and syndrome. Here we systematically characterize and summarize the global landscape of routine serotype-specific IPD surveillance in PCV10/13-using countries and describe the subset that are included in PSERENADE. Of 138 countries using PCV10/13 as of 2018, we identified 109 with IPD surveillance systems, 76 of which met PSERENADE data collection eligibility criteria. PSERENADE received data from most (n = 63, 82.9%), yielding 240,639 post-PCV10/13 introduction IPD cases. Pediatric and adult surveillance was represented from all geographic regions but was limited from lower income and high-burden countries. In PSERENADE, 18 sites evaluated PCV10, 42 PCV13, and 17 both; 17 sites used a 3 + 0 schedule, 38 used 2 + 1, 13 used 3 + 1, and 9 used mixed schedules. With such a sizeable and generally representative dataset, PSERENADE will be able to conduct robust analyses to estimate PCV impact and inform policy at national and global levels regarding adult immunization, schedule, and product choice, including for higher valency PCVs on the horizon.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,022
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,062
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,114

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0220,062
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,005
Bibliométrie0,0170,022
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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