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Enregistrement W3140118535 · doi:10.1038/s41598-021-86492-9

Unveiling the unknown phylogenetic position of the scallop Austrochlamys natans and its implications for marine stewardship in the Magallanes Province

2021· article· en· W3140118535 sur OpenAlexaff
Sebastián Rosenfeld, Cristián Aldea, Zambra López, Claudia S. Maturana, Jaime Ojeda, Francisco Bahamonde, Camille Détrée, Andrés Mansilla, Élie Poulin, Karin Gérard

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesFondo Nacional de Desarrollo Científico y TecnológicoComisión Nacional de Investigación Científica y TecnológicaInstituto de Ecología y Biodiversidad
Mots-clésScallopPhylogenetic treeLineage (genetic)BiologyPhylogeneticsEcologyEvolutionary biologyGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two species of scallop, Austrochlamys natans ("Ostión del Sur") and Zygochlamys patagonica ("Ostión patagonico") are presently exploited in the southern part of the Magallanes Province (MP). The lack of clarity in taxonomic identification and ecological aspects is generating both erroneous extraction statistics and an unperceived harvesting pressure on A. natans and Z. patagonica. We aim to discriminate these Magallanes scallops accurately, improve our understanding of their complex natural history and discuss possible implications for their management and conservation status, given the current fisheries statistics. To achieve these goals, we present a complete review of the historical identification of the Magallanes scallop and a multi-locus molecular phylogeny which allowed us to recover the phylogenetic position of A. natans. We sampled 54 individuals from five localities across the southern Pacific coast of the MP. We calculated the depth of the byssal notch (BND) and shell height (VH) ratio from morphological characters and conducted phylogenetic reconstructions with mitochondrial (12S and 16S) and nuclear markers (28S) using Bayesian and maximum likelihood analyses. Both morphology and molecular phylogeny identified two distinct entities, Z. patagonica and a distinct, highly divergent lineage that corresponds to A. natans. Our study provides integrative evidence to alert the current fishery management and the need for further conservation studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,044

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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