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Enregistrement W3140245308 · doi:10.21203/rs.3.rs-366992/v1

Dried blood spot specimens for SARS-CoV-2 antibody testing: A multi-site, multi-assay comparison

2021· preprint· en· W3140245308 sur OpenAlexafffundabout
François Cholette, Christine Mesa, Angela Harris, Hannah Ellis, Karla Cachero, Philip Lacap, Yannick Galipeau, Marc‐André Langlois, Anne‐Claude Gingras, Cédric P. Yansouni, Jesse Papenburg, Matthew P. Cheng, Pranesh Chakraborty, Derek R. Stein, Paul Van Caeseele, Sofia Bartlett, Mel Krajden, David A. Goldfarb, Allison McGeer, Carla Osiowy, Catherine Hankins, Bruce Mazer, Michael Drebot, John Kim

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensBC Centre for Disease ControlUniversity of British ColumbiaManitoba HealthChildren's Hospital of Eastern OntarioPublic Health Agency of CanadaUniversity of OttawaMcGill UniversityNewborn Screening OntarioUniversity of TorontoSinai Health SystemInstitute of Infection and ImmunityLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSerologyDried blood spotSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Gold standard (test)Predictive valueCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineDried bloodPopulationAntibodyVirologyDiagnostic testImmunologyInternal medicineBiologyVeterinary medicineEnvironmental healthDiseaseChemistryInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The true severity of infection due to COVID-19 is under-represented because it is based on only those who are tested. Although nucleic acid amplifications tests (NAAT) are the gold standard for COVID-19 diagnostic testing, serological assays provide better population-level SARS-CoV-2 prevalence estimates. Implementing large sero-surveys present several logistical challenges within Canada due its unique geography including rural and remote communities. Dried blood spot (DBS) sampling is a practical solution but comparative performance data on SARS-CoV-2 serological tests using DBS is currently lacking. Here we present test performance data from a well-characterized SARS-CoV-2 DBS panel sent to laboratories across Canada representing 10 commercial and 2 in-house developed tests for SARS-CoV-2 antibodies. Three commercial assays identified all positive and negative DBS correctly corresponding to a sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value of 100% (95% CI = 72.2, 100). Two in-house assays also performed equally well. In contrast, several commercial assays could not achieve a sensitivity greater than 40% or a negative predictive value greater than 60%. Our findings represent the foundation for future validation studies on DBS specimens that will play a central role in strengthening Canada’s public health policy in response to COVID-19.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,021
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,094
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,021
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,323
Tête enseignante GPT0,497
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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