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Enregistrement W3140788993 · doi:10.1073/pnas.2025453118

Genomic stability through time despite decades of exploitation in cod on both sides of the Atlantic

2021· article· en· W3140788993 sur OpenAlexaffabout
Malin L. Pinsky, Anne Maria Eikeset, Cecilia Helmerson, Ian Bradbury, Paul Bentzen, Corey J. Morris, Agata T. Gondek-Wyrozemska, Helle Tessand Baalsrud, Marine Servane Ono Brieuc, Olav Sigurd Kjesbu, Jane Aanestad Godiksen, Julia M. I. Barth, Michael Matschiner, Nils Chr. Stenseth, Kjetill S. Jakobsen, Sissel Jentoft, Bastiaan Star

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensDalhousie UniversityFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGadusAtlantic codBiologyEvolutionary biologyArcticGenetic diversityPopulationGenetic variationDemographic historyGenomeFishingEcologyGeneticsFisheryGeneDemographyFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

) that were collected before (early 20th century) and after (early 21st century) periods of intensive exploitation and rapid decline in the age of maturation from two geographically distinct populations in Newfoundland, Canada, and the northeast Arctic, Norway. Our temporal, genome-wide analyses of 346,290 loci show no substantial loss of genetic diversity and high effective population sizes. Moreover, we do not find distinct signals of strong selective sweeps anywhere in the genome, although we cannot rule out the possibility of highly polygenic evolution. Our observations suggest that phenotypic change in these populations is not constrained by irreversible loss of genomic variation and thus imply that former traits could be reestablished with demographic recovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,235
Score d'incertitude au seuil0,143

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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