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Enregistrement W3141564469 · doi:10.3390/microorganisms9040696

Changes in Invasive Pneumococcal Disease Caused by Streptococcus pneumoniae Serotype 1 following Introduction of PCV10 and PCV13: Findings from the PSERENADE Project

2021· article· en· W3141564469 sur OpenAlexaff
Julia C. Bennett, Marissa K. Hetrich, Maria Garcia Quesada, Jenna N. Sinkevitch, Maria Deloria Knoll, Daniel R. Feikin, Scott L. Zeger, E. Wangeci Kagucia, Adam L. Cohen, Krow Ampofo, Maria-Cristina de C. Brandileone, Dana Bruden, Romina Camilli, Jesús Castilla, Guanhao Chan, Heather Cook, Jennifer Cornick, Ron Dagan, Tine Dalby, Kostas Danis, Sara de Miguel, Philippe De Wals, Stefanie Desmet, Theano Georgakopoulou, Charlotte Gilkison, Marta Grgič-Vitek, Laura L. Hammitt, Markus Hilty, Pak‐Leung Ho, Sanjay Jayasinghe, James D. Kellner, Jackie Kleynhans, Mirjam J. Knol, Jana Kozáková, Karl G. Kristinsson, Shamez Ladhani, Laura MacDonald, Grant Mackenzie, Lucia Maďarová, Allison McGeer, Jolita Mereckiene, Eva Morfeldt, Tuya Mungun, Carmen Muñoz‐Almagro, J. Pekka Nuorti, Metka Paragi, Tamara Pilishvili, Rodrigo Puentes, Samir K. Saha, Aalisha Sahu Khan, Larisa Savrasova, J. Anthony G. Scott, Anna Skoczyńska, Shigeru Suga, Mark van der Linden, Jennifer R. Verani, Anne von Gottberg, Brita Askeland Winje, İnci Yıldırım, Khalid Zerouali, Kyla Hayford

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of CalgaryUniversity Health NetworkAlberta Health ServicesUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesPan American Health OrganizationEuropean Centre for Disease Prevention and ControlBill and Melinda Gates FoundationJohns Hopkins UniversityWorld Health Organization
Mots-clésStreptococcus pneumoniaeSerotypePneumococcal diseasePoisson regressionMedicineIncidence (geometry)Pneumococcal conjugate vaccinePneumococcal infectionsPediatricsDemographyEnvironmental healthImmunologyAntibioticsBiologyMicrobiologyMathematicsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

serotype 1 (ST1) was an important cause of invasive pneumococcal disease (IPD) globally before the introduction of pneumococcal conjugate vaccines (PCVs) containing ST1 antigen. The Pneumococcal Serotype Replacement and Distribution Estimation (PSERENADE) project gathered ST1 IPD surveillance data from sites globally and aimed to estimate PCV10/13 impact on ST1 IPD incidence. We estimated ST1 IPD incidence rate ratios (IRRs) comparing the pre-PCV10/13 period to each post-PCV10/13 year by site using a Bayesian multi-level, mixed-effects Poisson regression and all-site IRRs using a linear mixed-effects regression (N = 45 sites). Following PCV10/13 introduction, the incidence rate (IR) of ST1 IPD declined among all ages. After six years of PCV10/13 use, the all-site IRR was 0.05 (95% credibility interval 0.04-0.06) for all ages, 0.05 (0.04-0.05) for <5 years of age, 0.08 (0.06-0.09) for 5-17 years, 0.06 (0.05-0.08) for 18-49 years, 0.06 (0.05-0.07) for 50-64 years, and 0.05 (0.04-0.06) for ≥65 years. PCV10/13 use in infant immunization programs was followed by a 95% reduction in ST1 IPD in all ages after approximately 6 years. Limited data availability from the highest ST1 disease burden countries using a 3+0 schedule constrains generalizability and data from these settings are needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,145

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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