MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3141635963 · doi:10.1186/s13059-021-02320-3

Response to correspondence on “Reproducibility of CRISPR-Cas9 methods for generation of conditional mouse alleles: a multi-center evaluation”

2021· letter· en· W3141635963 sur OpenAlexaff
Channabasavaiah B. Gurumurthy, Aidan R. O’Brien, Rolen M. Quadros, John H. Adams, Pilar Alcaide, Shinya Ayabe, Johnathan Ballard, Surinder K. Batra, Marie‐Claude Beauchamp, Kathleen A. Becker, Guillaume Bernas, David Brough, Francisco J. Carrillo‐Salinas, Wesley Chan, Hanying Chen, Ruby Dawson, Victoria DeMambro, Jinke D’Hont, Katharine M. Dibb, James D. Eudy, Lin Gan, Jing Gao, Amy Gonzales, Anyonya R. Guntur, Huiping Guo, Donald W. Harms, Anne Harrington, Kathryn E. Hentges, Neil Humphreys, Shiho Imai, Hideshi Ishii, Mizuho Iwama, Eric Jonasch, Michelle Karolak, Bernard Keavney, Nay-Chi Khin, Masamitsu Konno, Yuko Kotani, Yayoi Kunihiro, Imayavaramban Lakshmanan, Catherine Larochelle, Catherine B. Lawrence, Lin Li, Volkhard Lindner, Xian-De Liu, Gloria López‐Castejón, Andrew Loudon, Jenna Lowe, Loydie Jerome-Majeweska, Taiji Matsusaka, Hiromi Miura, Yoshiki Miyasaka, Benjamin Morpurgo, Katherine J. Motyl, Yo-ichi Nabeshima, Koji Nakade, Toshiaki Nakashiba, Ken‐ichi Nakashima, Yuichi Obata, Sanae Ogiwara, Mariette Ouellet, Leif Oxburgh, Sandra Piltz, Ilka Pinz, Moorthy P. Ponnusamy, David Ray, Ronald Redder, Clifford J. Rosen, Nikki Ross, Mark Ruhe, Larisa Ryzhova, Ane Salvador, Sabrina Alam, Radislav Sedláček, Karan Sharma, Chad Smith, Katrien Staes, Lora Starrs, Fumihiro Sugiyama, Satoru Takahashi, Tomohiro Tanaka, Andrew W. Trafford, Yoshihiro Uno, Leen Vanhoutte, Frederique Vanrockeghem, Brandon Willis, Christian S. Wright, Yuko Yamauchi, Xin Yi, Kazuto Yoshimi, Xuesong Zhang, Yingxin Zhang, Masato Ohtsuka, Satyabrata Das, Daniel J. Garry, Tino Hochepied, Paul Q. Thomas, Jan Parker‐Thornburg, Antony Adamson, Atsushi Yoshiki, Jean-Francois Schmouth, Andrei Golovko, William R. Thompson, K. C. Kent Lloyd, Joshua A. Wood, Mitra Cowan, Tomoji Mashimo, Seiya Mizuno, Hao Zhu, Petr Kašpárek, Lucy Liaw, Joseph M. Miano, Gaétan Burgio

Notice bibliographique

RevueGenome biology · 2021
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesSchool of Medicine, Tokai UniversitySchool of Medicine, Indiana UniversityUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterWellcome TrustManchester Collaborative Centre for Inflammation ResearchUniversiteit GentUniversity of ManchesterBritish Heart FoundationUniversity of RochesterDirectorate for Biological SciencesMedical Research CouncilChildren’s Hospital of Wisconsin Research InstituteMedical Center, University of RochesterUniversity of Nebraska Medical Center
Mots-clésBiologyCRISPRHuman geneticsGeneticsAlleleComputational biologyCas9ReproducibilityGeneStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,397
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,452
Écart entre enseignants0,361 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentnon

Explorer davantage

Même revueGenome biologyMême sujetCRISPR and Genetic EngineeringTravaux en français237 207